More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0001 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
450 aa  926    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.59 
 
 
448 aa  370  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  41.21 
 
 
450 aa  346  5e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  40.85 
 
 
446 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.85 
 
 
446 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  42.99 
 
 
440 aa  344  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  42.38 
 
 
464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  41.44 
 
 
446 aa  343  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  40.62 
 
 
446 aa  342  7e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  40.62 
 
 
446 aa  342  7e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  40.62 
 
 
446 aa  342  7e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  40.62 
 
 
446 aa  342  7e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  40.62 
 
 
446 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  40.62 
 
 
446 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.62 
 
 
446 aa  339  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  40.44 
 
 
446 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.63 
 
 
443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.12 
 
 
444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  40.04 
 
 
450 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.02 
 
 
454 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  44.75 
 
 
442 aa  322  7e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  37.95 
 
 
449 aa  321  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.86 
 
 
463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  38.16 
 
 
457 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.98 
 
 
453 aa  320  3.9999999999999996e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  39.6 
 
 
436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  37.94 
 
 
457 aa  319  7e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  43.61 
 
 
451 aa  318  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  38.51 
 
 
452 aa  318  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.95 
 
 
457 aa  317  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  43 
 
 
453 aa  315  8e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  43 
 
 
453 aa  315  8e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.91 
 
 
470 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000133107  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0001  chromosomal replication initiation protein  44.54 
 
 
500 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0001  chromosomal replication initiation protein  38.36 
 
 
465 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000010295  decreased coverage  0.002869 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  38.53 
 
 
451 aa  311  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  37.94 
 
 
461 aa  311  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  38.08 
 
 
443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  37.7 
 
 
450 aa  310  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  37.81 
 
 
452 aa  309  5e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  37.81 
 
 
452 aa  309  5e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  43.85 
 
 
524 aa  309  5.9999999999999995e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  38.79 
 
 
441 aa  309  8e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  37.92 
 
 
455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  37.72 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.27 
 
 
456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 
460 aa  307  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  37.42 
 
 
449 aa  306  6e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  40.4 
 
 
445 aa  306  6e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  36.56 
 
 
459 aa  306  6e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 
460 aa  306  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  36.92 
 
 
460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  36.54 
 
 
462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  37.2 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  37.2 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  37.2 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.68 
 
 
469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  37.2 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.15 
 
 
455 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.06 
 
 
475 aa  303  6.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.202829  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  36.54 
 
 
462 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  37.64 
 
 
440 aa  302  9e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  36.52 
 
 
462 aa  302  9e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  36.85 
 
 
451 aa  302  1e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  36.85 
 
 
451 aa  302  1e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0001  chromosomal replication initiation protein  36.6 
 
 
476 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00109258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.44 
 
 
449 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  36.98 
 
 
460 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  36.21 
 
 
461 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03483  chromosomal replication initiation protein  45.13 
 
 
442 aa  300  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  35.78 
 
 
457 aa  300  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  35.55 
 
 
481 aa  300  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  36.2 
 
 
445 aa  300  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.12 
 
 
454 aa  299  6e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  41.9 
 
 
480 aa  299  6e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.44 
 
 
469 aa  299  8e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.55 
 
 
439 aa  298  9e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.64 
 
 
439 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0001  chromosomal replication initiation protein  42.69 
 
 
518 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3239  chromosomal replication initiation protein  42.69 
 
 
536 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457996  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  36.62 
 
 
461 aa  298  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.79 
 
 
474 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0537995  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2237  chromosomal replication initiation protein  42.69 
 
 
533 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0001  chromosomal replication initiation protein  42.69 
 
 
533 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0301  chromosomal replication initiation protein  42.69 
 
 
533 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  36.85 
 
 
465 aa  298  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2848  chromosomal replication initiation protein  42.69 
 
 
533 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  42.86 
 
 
478 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0089  chromosomal replication initiation protein  42.69 
 
 
533 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0103  chromosomal replication initiation protein  42.69 
 
 
533 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.17 
 
 
480 aa  297  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0001  chromosomal replication initiator protein, DnaA  35.84 
 
 
449 aa  296  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.54 
 
 
462 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  36.58 
 
 
467 aa  297  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  36.17 
 
 
463 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.58 
 
 
467 aa  296  4e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  36.58 
 
 
467 aa  296  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0001  chromosomal replication initiation protein  43.45 
 
 
524 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57647  hitchhiker  0.0000195718 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  36.58 
 
 
467 aa  296  4e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  36.58 
 
 
467 aa  296  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>