More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1812 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  53.1 
 
 
843 aa  815    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
941 aa  1946    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  38.88 
 
 
765 aa  506  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  38.44 
 
 
761 aa  476  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  37.15 
 
 
905 aa  463  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  35.55 
 
 
828 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  35.46 
 
 
814 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  35.83 
 
 
727 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  36.85 
 
 
727 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 
795 aa  414  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  37.11 
 
 
806 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  40.43 
 
 
709 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  33.66 
 
 
824 aa  406  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  32.91 
 
 
880 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  35.21 
 
 
705 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  33.12 
 
 
829 aa  369  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  34.81 
 
 
746 aa  350  5e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  34.36 
 
 
705 aa  347  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  34.51 
 
 
705 aa  347  7e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  34.51 
 
 
705 aa  347  7e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  34.36 
 
 
705 aa  346  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  34.36 
 
 
705 aa  345  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  34.36 
 
 
705 aa  345  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  34.57 
 
 
705 aa  342  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  34.52 
 
 
705 aa  342  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  33.53 
 
 
746 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  36.45 
 
 
661 aa  337  7e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  33 
 
 
668 aa  331  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  34.13 
 
 
643 aa  330  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  32.43 
 
 
912 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  33.83 
 
 
618 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  33.08 
 
 
640 aa  323  8e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  32.59 
 
 
706 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  34.87 
 
 
643 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  34.87 
 
 
643 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  32.67 
 
 
901 aa  320  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  32.84 
 
 
679 aa  320  7.999999999999999e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  33.94 
 
 
680 aa  318  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  34.55 
 
 
646 aa  318  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  35.57 
 
 
667 aa  317  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  35.4 
 
 
680 aa  317  7e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  35.57 
 
 
680 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0712  glycosyl transferase family 51  34.99 
 
 
916 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  36.11 
 
 
761 aa  316  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  35.23 
 
 
680 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  35.4 
 
 
680 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  35.23 
 
 
680 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  35.4 
 
 
673 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  35.4 
 
 
673 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  35.01 
 
 
776 aa  311  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  33.49 
 
 
679 aa  311  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  34.78 
 
 
770 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  33.17 
 
 
654 aa  305  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  34.15 
 
 
846 aa  304  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  34.15 
 
 
820 aa  304  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  31.66 
 
 
640 aa  304  5.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  34.15 
 
 
834 aa  304  6.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  32.95 
 
 
834 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  33.94 
 
 
625 aa  303  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  33.9 
 
 
835 aa  302  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  29.13 
 
 
830 aa  301  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  32.5 
 
 
708 aa  301  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.29 
 
 
648 aa  300  6e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  34.12 
 
 
681 aa  300  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  30.08 
 
 
705 aa  299  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2728  glycosyl transferase family 51  31.92 
 
 
918 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2124  glycosyl transferase family 51  29.89 
 
 
934 aa  299  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.563834  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  36.38 
 
 
732 aa  299  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  32.89 
 
 
721 aa  298  2e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  29 
 
 
820 aa  299  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  33.38 
 
 
837 aa  298  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  31.92 
 
 
693 aa  298  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  32.6 
 
 
649 aa  297  6e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  32.18 
 
 
837 aa  296  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  33.97 
 
 
683 aa  296  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  33.97 
 
 
683 aa  295  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  30.77 
 
 
648 aa  295  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  32.3 
 
 
638 aa  294  4e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  33.08 
 
 
830 aa  293  7e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  33.81 
 
 
683 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  28.76 
 
 
861 aa  293  8e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  32.31 
 
 
751 aa  293  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  33.7 
 
 
683 aa  293  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  33.7 
 
 
683 aa  293  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  36.82 
 
 
776 aa  293  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  33.6 
 
 
683 aa  293  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  33.81 
 
 
683 aa  292  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  33.54 
 
 
683 aa  292  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  32.92 
 
 
832 aa  291  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  32.82 
 
 
839 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  36.64 
 
 
779 aa  291  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  33.39 
 
 
683 aa  290  8e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  36.4 
 
 
734 aa  290  9e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  33.81 
 
 
683 aa  290  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  36.45 
 
 
714 aa  289  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  34.78 
 
 
679 aa  289  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  35.96 
 
 
734 aa  289  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  31.39 
 
 
683 aa  289  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  36.21 
 
 
714 aa  289  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  33.49 
 
 
683 aa  289  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>