More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4663 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  100 
 
 		 188 aa  374  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  83.61 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  74.34 
 
 		 159 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  73.51 
 
 		 166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  72.11 
 
 		 171 aa  214  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  68.49 
 
 		 153 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  63.4 
 
 		 170 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  70.12 
 
 		 167 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  81.15 
 
 		 195 aa  211  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  70.99 
 
 		 175 aa  210  7.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  69.14 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  80.33 
 
 		 182 aa  209  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  68.25 
 
 		 186 aa  207  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  60.11 
 
 		 164 aa  206  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  61.03 
 
 		 192 aa  206  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  78.69 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  62.89 
 
 		 177 aa  204  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  77.87 
 
 		 193 aa  204  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  53.27 
 
 		 188 aa  204  7e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  78.69 
 
 		 189 aa  204  8e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  61.17 
 
 		 156 aa  204  9e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  78.33 
 
 		 173 aa  203  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  75.41 
 
 		 198 aa  202  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  70.2 
 
 		 300 aa  202  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  72.6 
 
 		 169 aa  202  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  76.23 
 
 		 200 aa  199  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  75.41 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  60.32 
 
 		 165 aa  198  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  72.12 
 
 		 182 aa  197  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  61.5 
 
 		 170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  63.35 
 
 		 166 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  61.34 
 
 		 172 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  61.34 
 
 		 172 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  61.34 
 
 		 172 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  73.77 
 
 		 168 aa  191  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  63.4 
 
 		 170 aa  190  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  70.49 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  57.37 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  71.82 
 
 		 171 aa  177  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  59.29 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  46.6 
 
 		 193 aa  168  5e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  52.2 
 
 		 167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  63.93 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  52.41 
 
 		 179 aa  154  6e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  46 
 
 		 148 aa  140  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  62.5 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  53.28 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  49.22 
 
 		 179 aa  125  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  46.72 
 
 		 305 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  45.67 
 
 		 148 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  42.74 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  41.41 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  35.48 
 
 		 164 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  34.22 
 
 		 172 aa  91.7  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  41.32 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  38.46 
 
 		 118 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  41.6 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  33.86 
 
 		 169 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  41.03 
 
 		 230 aa  85.5  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  33.86 
 
 		 170 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  33.51 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  33.51 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  33.51 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  33.51 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  33.51 
 
 		 172 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  33.51 
 
 		 172 aa  84.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  42.59 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  32.98 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  34.27 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  36.23 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  32.98 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  33.88 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  38.33 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  36.14 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  33.52 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  36.45 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  36.8 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  34.53 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  42.24 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  40 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  40 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  36.42 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  36.42 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  36.42 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 163 aa  77.4  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  38 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  34.42 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  42 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  34.93 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  33.88 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  35.14 
 
 		 143 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  34.91 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  43 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>