74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4290 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4290  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 315 aa  628  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.814219  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1542  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.63 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0477003  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  42.11 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  46.73 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2036  hypothetical protein  35.22 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  36.76 
 
 		 855 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  34.51 
 
 		 713 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0104  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  47.19 
 
 		 141 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.09 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  39.29 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.16 
 
 		 738 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0097  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 		 155 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0115417  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000159202  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.6 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.71 
 
 		 750 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  36.8 
 
 		 142 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.7 
 
 		 137 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  35.94 
 
 		 1039 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.33 
 
 		 549 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.77 
 
 		 573 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  31.78 
 
 		 591 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 142 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0493061  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.24 
 
 		 135 aa  52.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.36 
 
 		 122 aa  52.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  33.9 
 
 		 817 aa  52.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.8 
 
 		 613 aa  52.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211721  hitchhiker  0.0066599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3741  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 		 133 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  0.012325 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  32.79 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  31.53 
 
 		 722 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.19 
 
 		 655 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  36.96 
 
 		 1225 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  34.68 
 
 		 766 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  33.86 
 
 		 716 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 119 aa  49.3  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0164  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 		 174 aa  49.7  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  33.02 
 
 		 132 aa  49.3  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.71 
 
 		 952 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.45 
 
 		 161 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  33.86 
 
 		 745 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  38.3 
 
 		 155 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2379  putative serine/threonine kinaseanti-sigma factor  35.96 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.084958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.74 
 
 		 177 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.5 
 
 		 616 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 		 147 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  30.3 
 
 		 697 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  34.48 
 
 		 771 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.79 
 
 		 775 aa  47.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  36.17 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.84 
 
 		 1045 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1572  putative signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 161 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 203 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  35.14 
 
 		 693 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2297  hypothetical protein  32.17 
 
 		 134 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000200107  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.25 
 
 		 728 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  33.61 
 
 		 123 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5025  putative signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 166 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2037  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.89 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  36.04 
 
 		 713 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 		 207 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 		 192 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.7 
 
 		 579 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.51 
 
 		 688 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3612  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.65 
 
 		 185 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2666  putative signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 432 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 		 159 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6464  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  29.31 
 
 		 164 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.675812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4491  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 160 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5093  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.38 
 
 		 132 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>