60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0096 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  732    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  63.71 
 
 		 362 aa  450  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  47.98 
 
 		 366 aa  347  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  54.62 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  51.38 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  44.41 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  51.72 
 
 		 361 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  52.69 
 
 		 355 aa  333  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  48.62 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  48.93 
 
 		 366 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  49.23 
 
 		 365 aa  325  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  47.49 
 
 		 369 aa  324  1e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  43.02 
 
 		 369 aa  299  6e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  46.2 
 
 		 325 aa  296  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  42.74 
 
 		 369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  49 
 
 		 367 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  43.2 
 
 		 367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  41.95 
 
 		 356 aa  257  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  42.42 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  44.03 
 
 		 368 aa  249  8e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  40.49 
 
 		 362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  38.81 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  38.44 
 
 		 360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  37.22 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  38.66 
 
 		 367 aa  228  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  40.86 
 
 		 375 aa  225  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  35.8 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  35.28 
 
 		 371 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  35 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  34.78 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  31.01 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  35.19 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  33.71 
 
 		 354 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  36.54 
 
 		 381 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  31.28 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  30.51 
 
 		 357 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  32.77 
 
 		 358 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  29.3 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  25.47 
 
 		 371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  29.08 
 
 		 983 aa  139  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  32.56 
 
 		 370 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  28.85 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  30.87 
 
 		 994 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  28.5 
 
 		 999 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  23.99 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  27.36 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  27.18 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  29.43 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  25.16 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  28.37 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  25.52 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  25.52 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  25.52 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  24.71 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  23.13 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  23.56 
 
 		 365 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  24.9 
 
 		 409 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  20.95 
 
 		 427 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  22.9 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  25.14 
 
 		 361 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>