More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1128 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 296 aa  603  9.999999999999999e-173  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  48.48 
 
 		 306 aa  280  3e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  38.49 
 
 		 317 aa  185  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  35.12 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  35.71 
 
 		 318 aa  182  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.12 
 
 		 349 aa  181  9.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  37.72 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  35.05 
 
 		 333 aa  180  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  32.87 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  34.29 
 
 		 307 aa  175  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  34.36 
 
 		 314 aa  175  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  38.31 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  34.88 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  35.4 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  32.78 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  35.64 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  34.52 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  33.22 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  35.09 
 
 		 301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  32.39 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  32.36 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  35.86 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  34.66 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  35.38 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  34.12 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  33.73 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  30.06 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  30.46 
 
 		 331 aa  152  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  33.47 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  30.36 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  30.36 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  32.68 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  33.46 
 
 		 506 aa  149  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  30.55 
 
 		 312 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  31.01 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  31.35 
 
 		 285 aa  149  7e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  31.8 
 
 		 316 aa  148  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  29.43 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  32.12 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  33.58 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  32.38 
 
 		 294 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  31.87 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  31.45 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  32.14 
 
 		 322 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  31.58 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  29.02 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  29.97 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  31.29 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  31.56 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  27.42 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  31.8 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  29.5 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  30.55 
 
 		 311 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  28.06 
 
 		 314 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  29.68 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  29.43 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 		 368 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  28.12 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.72 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  29.29 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  30.33 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  29.79 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  29.14 
 
 		 315 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  30.91 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  32.59 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  29.39 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  29.24 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  28.83 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  28.1 
 
 		 358 aa  135  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  31.77 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  29.72 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  28.93 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  29.75 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  28.85 
 
 		 312 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.14 
 
 		 514 aa  132  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  29.54 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  29.47 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  29.48 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  30.07 
 
 		 307 aa  132  9e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  28.83 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  30.04 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  29.2 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  29.23 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  30.2 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.14 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  29 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  33.47 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  28.37 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.37 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  31.56 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.37 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  26.21 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  29.13 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  28.4 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  30.2 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  28.01 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  28.87 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>