113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2770 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  100 
 
 		 408 aa  850    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  63.14 
 
 		 407 aa  551  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  61.18 
 
 		 407 aa  529  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  63.39 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  53.07 
 
 		 411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  54.04 
 
 		 400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  51.84 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  54.79 
 
 		 407 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  52.09 
 
 		 411 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  50.86 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  50.61 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  50.61 
 
 		 413 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  50.62 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  50.12 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  52.58 
 
 		 409 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  52.97 
 
 		 410 aa  424  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  49.14 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  50.12 
 
 		 409 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  50.37 
 
 		 409 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  51.83 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  49.14 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  48.64 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  47.54 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  49.63 
 
 		 409 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  54.69 
 
 		 373 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  48.04 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  45.34 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  47.91 
 
 		 413 aa  378  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  45.57 
 
 		 411 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  44.31 
 
 		 413 aa  357  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  45.07 
 
 		 407 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  45.07 
 
 		 407 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  45.07 
 
 		 407 aa  354  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  41.48 
 
 		 411 aa  352  5.9999999999999994e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  44.83 
 
 		 407 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  43.31 
 
 		 444 aa  316  4e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  40.29 
 
 		 409 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  41.67 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  41.13 
 
 		 410 aa  309  6.999999999999999e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  42.51 
 
 		 410 aa  299  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  44.08 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  39.41 
 
 		 415 aa  292  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  33.33 
 
 		 408 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  32.76 
 
 		 406 aa  246  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  32.51 
 
 		 407 aa  242  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  33.01 
 
 		 419 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.76 
 
 		 421 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  33.09 
 
 		 405 aa  236  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  32.67 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  31.94 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  32.18 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  30.05 
 
 		 418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  28.68 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  28.75 
 
 		 436 aa  193  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  28.53 
 
 		 413 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  27.09 
 
 		 409 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  31.11 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  24.86 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  24.86 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  26.63 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  26.63 
 
 		 359 aa  126  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  26.5 
 
 		 817 aa  100  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  22.66 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  29.71 
 
 		 178 aa  90.1  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  23.26 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  21.82 
 
 		 396 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  21.23 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  24.44 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  23.77 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  24.07 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  26.96 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  21.76 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  24.14 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  22.56 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  21.82 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  22.77 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  21.27 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  23.71 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  24.42 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  27.7 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  25.25 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  20.96 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  24.24 
 
 		 226 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 346 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  20.55 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  22.07 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  21.74 
 
 		 240 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  24.63 
 
 		 222 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  22.11 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  25 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  29.06 
 
 		 303 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  21.23 
 
 		 310 aa  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  23.27 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  22.63 
 
 		 282 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  23.27 
 
 		 303 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  19.66 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  20.83 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  24 
 
 		 223 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0706  methyltransferase type 12  28.85 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0371032 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>