More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3242 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  100 
 
 		 339 aa  679    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2565  transketolase, central region  66.06 
 
 		 354 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430096  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0108  transketolase, central region  59.01 
 
 		 329 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0108  transketolase central region  59.32 
 
 		 329 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741994  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3331  transketolase central region  57.94 
 
 		 324 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04530  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  56.11 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0057  transketolase  55.69 
 
 		 353 aa  363  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0329  Transketolase central region  56.88 
 
 		 335 aa  361  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7268  transketolase central region  54.79 
 
 		 388 aa  355  5e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.801653  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3625  transketolase, central region  55.62 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295636  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3630  transketolase, central region  55.62 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3698  transketolase, central region  55.62 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8973  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  54.32 
 
 		 327 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1382  transketolase, central region  55.08 
 
 		 336 aa  351  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0032  transketolase, central region  57.51 
 
 		 327 aa  350  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1400  Transketolase central region  54.49 
 
 		 336 aa  348  5e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000179702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0026  Transketolase central region  58.23 
 
 		 330 aa  348  8e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  52.07 
 
 		 342 aa  348  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4857  Transketolase central region  55.14 
 
 		 326 aa  346  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4085  transketolase, central region  52.99 
 
 		 351 aa  345  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0092  Transketolase central region  55.59 
 
 		 331 aa  345  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3966  Transketolase central region  51.83 
 
 		 357 aa  345  6e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0181  putative branched-chain alpha keto acid dehydrogenase E1 beta subunit  54.13 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6170  Transketolase central region  55 
 
 		 334 aa  343  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0762568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3381  Transketolase central region  54.27 
 
 		 357 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410697  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4508  transketolase, central region  53.87 
 
 		 326 aa  342  5e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6069  Transketolase central region  52.78 
 
 		 328 aa  342  8e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3222  Transketolase central region  54.49 
 
 		 345 aa  341  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35860  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  49.86 
 
 		 393 aa  340  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.147961 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5418  Transketolase central region  53.23 
 
 		 326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  50.46 
 
 		 329 aa  339  2.9999999999999998e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1596  transketolase central region  55.94 
 
 		 325 aa  339  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0994447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06810  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  57.05 
 
 		 355 aa  339  2.9999999999999998e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.643583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6982  Transketolase central region  52.24 
 
 		 340 aa  338  8e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00420  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  55.17 
 
 		 343 aa  335  5.999999999999999e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5002  Transketolase central region  55.81 
 
 		 325 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00992852  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  52.48 
 
 		 324 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  52.8 
 
 		 324 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  52.8 
 
 		 324 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2098  Transketolase central region  55.59 
 
 		 338 aa  332  4e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4287  Transketolase central region  53.09 
 
 		 327 aa  332  6e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3192  transketolase, central region  52.45 
 
 		 370 aa  331  8e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2904  Transketolase central region  53.5 
 
 		 373 aa  331  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2239  transketolase central region  56.01 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.171519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3399  Transketolase central region  55.19 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  52.48 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25390  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  52.92 
 
 		 330 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0987322  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12518  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit pdhB  51.59 
 
 		 348 aa  328  9e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5310  Transketolase central region  53.05 
 
 		 335 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2487  transketolase  54.69 
 
 		 329 aa  325  7e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.511484  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38870  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  53.23 
 
 		 345 aa  325  9e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.478414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2098  transketolase, central region  53.77 
 
 		 334 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3854  dehydrogenase E1 component  52.81 
 
 		 706 aa  321  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.886533  normal  0.152539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  51.55 
 
 		 326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  49.38 
 
 		 324 aa  318  6e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  49.07 
 
 		 324 aa  318  9e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3817  Transketolase central region  50.31 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0238  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  53.11 
 
 		 326 aa  316  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.26153  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  50.62 
 
 		 326 aa  315  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  48.3 
 
 		 320 aa  315  8e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  47.85 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  49.54 
 
 		 326 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  49.08 
 
 		 327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4027  transketolase, central region  49.38 
 
 		 326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  53.58 
 
 		 323 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  52.19 
 
 		 349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  50.62 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  52.94 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  49.4 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.47 
 
 		 325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  48.61 
 
 		 326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  46.93 
 
 		 326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  49.07 
 
 		 325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3747  Transketolase central region  50 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  46.63 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  47.55 
 
 		 351 aa  306  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  50 
 
 		 328 aa  305  9.000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  48.92 
 
 		 325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  48.61 
 
 		 336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  49.39 
 
 		 332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3246  transketolase, central region  48.15 
 
 		 334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  47.16 
 
 		 342 aa  302  5.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  52.16 
 
 		 326 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  48.3 
 
 		 325 aa  301  9e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  47.37 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  47.37 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  48.77 
 
 		 335 aa  300  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  49.54 
 
 		 327 aa  299  5e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  48.76 
 
 		 326 aa  298  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  48.73 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  50.31 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  49.07 
 
 		 326 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19910  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  46.93 
 
 		 333 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.045452  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.68 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  47.68 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.68 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.68 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  47.68 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.68 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.68 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>