More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1079 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 200 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1897  two component transcriptional regulator, LuxR family  57 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.25 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  52.74 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.02 
 
 		 202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  48.76 
 
 		 197 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.26 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.26 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.45 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  46.27 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  47.26 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.04 
 
 		 201 aa  168  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.43 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.28 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 201 aa  165  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  46.53 
 
 		 202 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.27 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.31 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.5 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.15 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 204 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  45.77 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.71 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  45.27 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.24 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.29 
 
 		 201 aa  154  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.27 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.93 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.27 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  42.79 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  41.21 
 
 		 204 aa  147  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  36.32 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3506  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.64 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  144  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  36.5 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  37 
 
 		 200 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  37 
 
 		 200 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  37 
 
 		 200 aa  141  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  37 
 
 		 200 aa  141  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 200 aa  141  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 205 aa  140  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  37 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  37 
 
 		 200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  41.79 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.8 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  37 
 
 		 200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  35.5 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  40.78 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.02 
 
 		 211 aa  134  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7316  response regulator receiver protein  36.82 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0357  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  38.81 
 
 		 202 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.59 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0351  LuxR family DNA-binding response regulator  39.09 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 226 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0355  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.58 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.881439  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1383  two component LuxR family transcriptional regulator  31 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000320378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1410  response regulator receiver  31 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000440417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0889  LuxR family DNA-binding response regulator  31.5 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000916195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0782  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.02 
 
 		 220 aa  121  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3621  two component LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 198 aa  121  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3818  two component LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 198 aa  121  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 198 aa  121  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3696  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.54 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.24 
 
 		 224 aa  115  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  32.49 
 
 		 200 aa  116  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  31.78 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  31.78 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2610  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.59 
 
 		 144 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000438854  normal  0.0112001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>