264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5604 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  85.22 
 
 		 203 aa  341  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  77.34 
 
 		 203 aa  317  7e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  77.34 
 
 		 203 aa  317  7e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  77.34 
 
 		 203 aa  317  7e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2851  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.796237  normal  0.0465369 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  30.09 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  23.63 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  26.77 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  27.27 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  27.27 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  26.77 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  26.77 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  26.77 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.18 
 
 		 427 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  25.76 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  25.76 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0564  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  28.32 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.87 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.87 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  25.25 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3338  phosphoglycerate mutase  25.53 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000263066  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.87 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  27.36 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.49 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.49 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  24.84 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57574  putative transcription initiation factor  30.61 
 
 		 439 aa  55.1  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.625866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  27.56 
 
 		 236 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0349  Phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4696  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  27.5 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.62 
 
 		 442 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 412 aa  52.4  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  27.16 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.65 
 
 		 382 aa  52  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  27.11 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.55 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.97 
 
 		 369 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  24.29 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.62 
 
 		 442 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5107  phosphoglycerate mutase family protein, putative  29.7 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 		 445 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  29.45 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  29.61 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.65 
 
 		 442 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  25.71 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  23.08 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  23.84 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  23.84 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  26.95 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1187  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  46.05 
 
 		 167 aa  49.3  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.130785  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3303  phosphoglycerate mutase  27.56 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  32.73 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  21.98 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 411 aa  48.9  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0126  putative phosphoglycerate mutase family protein  29.22 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.79 
 
 		 236 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5114  putative phosphoglycerate mutase family protein  29.87 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0497299  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0238  phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 402 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  27.22 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0934  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  40.68 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  47.27 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0998048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>