More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5539 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.99 
 
 
300 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  54.29 
 
 
311 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.14 
 
 
324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.9 
 
 
324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  50.35 
 
 
301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.42 
 
 
326 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0594  hypothetical protein  54.45 
 
 
304 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.62 
 
 
319 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.68 
 
 
301 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.614226  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.35 
 
 
297 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.463759  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3855  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.33 
 
 
304 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00441298  normal  0.0499961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.13 
 
 
312 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 
301 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  35.13 
 
 
312 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  31.02 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  33.56 
 
 
310 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  31.96 
 
 
298 aa  109  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  29.86 
 
 
298 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  29.33 
 
 
311 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.35 
 
 
310 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  31.27 
 
 
297 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  32.01 
 
 
301 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.99 
 
 
310 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  29.29 
 
 
294 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.61 
 
 
324 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  32.23 
 
 
310 aa  99.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  30.47 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  35.21 
 
 
379 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  31.16 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 
307 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  27.56 
 
 
300 aa  92.4  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.86 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  29.12 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  30.72 
 
 
308 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  30.72 
 
 
308 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  28.98 
 
 
301 aa  89  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  25.72 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  33.03 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.45 
 
 
326 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  30.17 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  29.67 
 
 
302 aa  86.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 
306 aa  85.9  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  30.85 
 
 
310 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  29.11 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  29.45 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  29.45 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  28.87 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.68 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  29.27 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  30.51 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  30.51 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  30.51 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  30.51 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  30.51 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  29.96 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  28.15 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  30.2 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  30.38 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  30.6 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  30.94 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  30.63 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  31.52 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  30.95 
 
 
314 aa  79  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  28.62 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  26.57 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  29.5 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  28.67 
 
 
324 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  25.5 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.96 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  30.63 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  30.03 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  28.78 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  29.35 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  30.18 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  32.65 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  27.27 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.74 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  23.26 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  21.92 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  31.12 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.96 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  28.28 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  25.09 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  27.24 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  27.82 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  28.27 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.88 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.88 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  28.03 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  29.97 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  30.18 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  27.57 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>