269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1995 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  100 
 
 		 323 aa  624  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  66.25 
 
 		 328 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  62.31 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  62.31 
 
 		 331 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  58.39 
 
 		 341 aa  358  7e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  58.84 
 
 		 328 aa  350  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  57.76 
 
 		 342 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  61.11 
 
 		 331 aa  341  8e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  58.96 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  51.39 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  52.7 
 
 		 327 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  52.35 
 
 		 327 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  53.74 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  45.05 
 
 		 325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  45.45 
 
 		 338 aa  225  8e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  37.38 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  36.57 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  34.82 
 
 		 333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  33.85 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  34.17 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  36.33 
 
 		 336 aa  180  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  33.85 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  36.13 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  34.88 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  34.26 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  34.57 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  33.64 
 
 		 327 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  31.17 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  32.51 
 
 		 323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  39.67 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 		 479 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  37.67 
 
 		 481 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  24.71 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  36.1 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  27.12 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  32.16 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  34.73 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  30.36 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  33.94 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1802  AIR synthase related protein  27.27 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.24 
 
 		 741 aa  63.9  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  27.8 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  28.22 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  31.51 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  27.94 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  34.02 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  37.01 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  32.73 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  28.51 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  26.69 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  34.02 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  29.15 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  31.62 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  35.29 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  26.69 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  27.67 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  29.3 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  32 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  34.82 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  33.51 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0436  succinate dehydrogenase  26.82 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  29.39 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.92 
 
 		 779 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.91 
 
 		 779 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  27.58 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1539  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.22 
 
 		 717 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3455  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.36 
 
 		 737 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.92 
 
 		 779 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  28.77 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  33.8 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  31.42 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1936  AIR synthase related protein domain protein  28.8 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  29.73 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  32.89 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  32.89 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  26.24 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  34.53 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  32.89 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2051  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.45 
 
 		 715 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00206417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  32.89 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  32.89 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  32.89 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  32.89 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.28 
 
 		 766 aa  53.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.32 
 
 		 779 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.494756  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  30.07 
 
 		 329 aa  53.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.22 
 
 		 746 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  29.52 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  31.67 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  25.61 
 
 		 727 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  27.66 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  30.14 
 
 		 338 aa  53.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  29.8 
 
 		 349 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.01 
 
 		 340 aa  52.8  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1227  AIR synthase related protein  26.6 
 
 		 442 aa  52.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  27.12 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  28.42 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1879  AIR synthase related protein domain protein  26.41 
 
 		 443 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0640  AIR synthase related protein domain protein  23.91 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221872  normal  0.692624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>