More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0196 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  100 
 
 		 325 aa  639    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  49.5 
 
 		 314 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  52.6 
 
 		 311 aa  289  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.2 
 
 		 311 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.7 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  45.61 
 
 		 336 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  48.36 
 
 		 318 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  43.65 
 
 		 366 aa  258  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.65 
 
 		 366 aa  256  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.61 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  39.27 
 
 		 250 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.15 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.25 
 
 		 310 aa  186  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.84 
 
 		 314 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  36 
 
 		 819 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  33.65 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.13 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1667 aa  159  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.41 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.19 
 
 		 354 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3013  hypothetical protein  34.68 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.22 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  32.41 
 
 		 1094 aa  142  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.65 
 
 		 354 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.29 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.36 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.81 
 
 		 415 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  31.25 
 
 		 810 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.15 
 
 		 353 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  34.49 
 
 		 556 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.9 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  31.14 
 
 		 391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.84 
 
 		 366 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.32 
 
 		 752 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.12 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  27.41 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  28.94 
 
 		 580 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.54 
 
 		 607 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 		 689 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.33 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.71 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  29.54 
 
 		 387 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  28.93 
 
 		 329 aa  119  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  31.52 
 
 		 479 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  29.62 
 
 		 971 aa  116  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.83 
 
 		 365 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.11 
 
 		 326 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.73 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  28.27 
 
 		 487 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.34 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.83 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.11 
 
 		 347 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  32.12 
 
 		 776 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0482  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.11 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.54 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.12 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.35 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  31.58 
 
 		 1189 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.18 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.61 
 
 		 329 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.81 
 
 		 328 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.8 
 
 		 312 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  27.15 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.88 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.22 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.87 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.91 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.62 
 
 		 457 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.1 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.69 
 
 		 334 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.28 
 
 		 517 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.42 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.8 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.03 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.47 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.75 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  27.88 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.51 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.57 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.46 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.41 
 
 		 362 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.08 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.32 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.2 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.2 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.2 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.52 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.13 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.08 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.52 
 
 		 1170 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.67 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1252  putative signal peptide protein  23.36 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.989203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.66 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.66 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.68 
 
 		 377 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.05 
 
 		 417 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.84 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.45 
 
 		 318 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.08 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1172  cytochrome d1 heme region  23.94 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.912749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>