154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0730 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0730  SPP-like hydrolase  100 
 
 
222 aa  446  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.842566  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2884  SPP-like hydrolase  50.89 
 
 
233 aa  222  4e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0257  hydrolase  32.84 
 
 
240 aa  102  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.509124  hitchhiker  0.000575913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  34.08 
 
 
554 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  34.08 
 
 
554 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1945  HAD family hydrolase  34.23 
 
 
250 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8838  hypothetical protein  32.44 
 
 
572 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1727  HAD family hydrolase  29.22 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  34.23 
 
 
550 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1101  HAD family hydrolase  27.51 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.744434  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0884  SPP-like hydrolase  29.26 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1822  HAD superfamily hydrolase  30.34 
 
 
261 aa  58.9  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0525  Cof-like hydrolase  39.24 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4533  hypothetical protein  27.87 
 
 
287 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.125216  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4408  putative conserved hypothetical protein  27.87 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0949977 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1965  SPP-like hydrolase  33.33 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0481119  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  37.66 
 
 
265 aa  52.8  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2130  SPP-like hydrolase  35.9 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000000113582  hitchhiker  0.0000579549 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4607  hypothetical protein  27.32 
 
 
287 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.356417  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1633  SPP-like hydrolase  39.02 
 
 
237 aa  52.4  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.64059  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  41.03 
 
 
264 aa  52.4  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0540  HAD superfamily hydrolase  47.14 
 
 
277 aa  52.4  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.467254  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  36.26 
 
 
274 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1097  HAD superfamily hydrolase  33.75 
 
 
273 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000207763  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1223  SPP-like hydrolase  37.04 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0131794  normal  0.788944 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0685  SPP-like hydrolase  37.84 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  41.03 
 
 
268 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  37.5 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1166  SPP-like hydrolase  34.38 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  37.18 
 
 
275 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2337  phosphoglycolate phosphatase  36.84 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  0.0135027 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1851  Cof-like hydrolase  38.16 
 
 
274 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  34.62 
 
 
265 aa  48.9  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  32.91 
 
 
266 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  36.25 
 
 
271 aa  48.9  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  32.22 
 
 
281 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  36.26 
 
 
282 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1070  SPP-like hydrolase  39.66 
 
 
228 aa  48.5  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0195406  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2078  HAD superfamily hydrolase  33.73 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  37.04 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  32.22 
 
 
281 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9904  predicted protein  29.58 
 
 
276 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  35.62 
 
 
277 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  37.66 
 
 
273 aa  47.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  34.31 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  34.78 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  32.22 
 
 
281 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  26.96 
 
 
270 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0457  Cof-like hydrolase  33.8 
 
 
270 aa  46.6  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf242  COF family HAD hydrolase protein  43.64 
 
 
318 aa  46.6  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00196152  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1759  HAD-superfamily cof-like hydrolase  32.47 
 
 
289 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  34.67 
 
 
270 aa  46.2  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  27.03 
 
 
270 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  28.93 
 
 
270 aa  46.2  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5151  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.48 
 
 
321 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  35.62 
 
 
277 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  35.53 
 
 
269 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  38.03 
 
 
270 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  38.03 
 
 
270 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  29.89 
 
 
271 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  38.03 
 
 
270 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  38.03 
 
 
270 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  38.03 
 
 
270 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  29.89 
 
 
271 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  29.89 
 
 
271 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  35.21 
 
 
270 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  35.21 
 
 
270 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  38.03 
 
 
270 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  29.89 
 
 
271 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  29.89 
 
 
271 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  29.89 
 
 
271 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  38.03 
 
 
270 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  29.89 
 
 
271 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  38.03 
 
 
270 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  29.89 
 
 
271 aa  45.8  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  31.79 
 
 
234 aa  45.4  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  31.43 
 
 
268 aa  45.4  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  40.35 
 
 
268 aa  45.4  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  27.12 
 
 
274 aa  45.4  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6758  predicted protein  32.39 
 
 
259 aa  45.1  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.254301 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  31.65 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.09 
 
 
308 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  26.09 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3874  HAD family hydrolase  23.86 
 
 
260 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0597322 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2000  HAD superfamily hydrolase  31.25 
 
 
273 aa  44.3  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1081  Cof-like hydrolase  30.12 
 
 
284 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00468672  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  35.8 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  34.21 
 
 
269 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  34.21 
 
 
269 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  29.41 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0908  sugar phosphatase SupH  29.41 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.75 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0041  SPP-like hydrolase  39.34 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4133  HAD family hydrolase  31.75 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3819  HAD-superfamily hydrolase  31.75 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.16 
 
 
267 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0996454  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  35.21 
 
 
270 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0120  Cof-like hydrolase  38.55 
 
 
274 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.39 
 
 
273 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  27 
 
 
244 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>