More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1945 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1945  HAD family hydrolase  100 
 
 		 250 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8838  hypothetical protein  52.23 
 
 		 572 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1727  HAD family hydrolase  50.68 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  38.86 
 
 		 554 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  38.86 
 
 		 554 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  35.19 
 
 		 550 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0730  SPP-like hydrolase  34.23 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.842566  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2884  SPP-like hydrolase  30.09 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1101  HAD family hydrolase  29.02 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.744434  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0257  hydrolase  27.85 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.509124  hitchhiker  0.000575913 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  27.78 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1119  SPP-like hydrolase  30.77 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.660919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2034  phosphoglycolate phosphatase  27.94 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.376803  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2100  SPP-like hydrolase  26.58 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  26.04 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  24.89 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  26.19 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2879  phosphotransferase  24.81 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  25.11 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  25.11 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1965  SPP-like hydrolase  28.44 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0481119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.55 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  23.53 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  23.51 
 
 		 271 aa  62  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  22.99 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  23.53 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  22.79 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.32 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  25.56 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  25.38 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.55 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2044  Cof-like hydrolase  32.09 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0884  SPP-like hydrolase  25.46 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  25.4 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3317  Cof-like hydrolase  35 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000026375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  24.9 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  24.63 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  24.71 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  25.37 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  22.67 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  22.67 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2337  phosphoglycolate phosphatase  26.58 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  0.0135027 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  22.67 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  24.66 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1166  SPP-like hydrolase  28.51 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.67 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  25.73 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  24.63 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  24.63 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  22.89 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  24.63 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0559  putative HAD superfamily hydrolase  23.4 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0605487  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  26.69 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  24.25 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.27 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  40.74 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  24.63 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0525  Cof-like hydrolase  23.02 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  24.63 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  24.63 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.27 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  25.39 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  26.53 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2968  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.89 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  24.56 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0900  Cof-like hydrolase  24.19 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.183998  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  23.55 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  21.86 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0848  phosphotransferase  24.61 
 
 		 286 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  24.79 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  21.86 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  40.98 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0716  HAD family phosphatase  23.27 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  26.45 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1070  SPP-like hydrolase  25.22 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0195406  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0394  Cof-like hydrolase  25.59 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0685  SPP-like hydrolase  24.55 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3590  HAD family hydrolase  27.42 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.684772  normal  0.0477257 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  38.96 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  27.1 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  21.86 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0986  hypothetical protein  24.07 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  25.65 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  23.37 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  25.62 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  24.34 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  24.34 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  24.34 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  25.21 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  34.18 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  23.94 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  27.31 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  21.46 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0840  Cof-like hydrolase  23.46 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381548 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  24.33 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  24.81 
 
 		 286 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  25.76 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0820  phosphotransferase  24.81 
 
 		 286 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0911  phosphotransferase  24.81 
 
 		 286 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>