More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0716 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0716  HAD family phosphatase  100 
 
 		 256 aa  523  1e-148  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  37.31 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0394  Cof-like hydrolase  39.77 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0259  Cof-like hydrolase  34.44 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000719541  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0258  Cof-like hydrolase  33.46 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000345946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.33 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.07 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  33.07 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.68 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  32.68 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  32.68 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  32.68 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  32.28 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.28 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  32.28 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  32.05 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0700  putative HAD superfamily hydrolase  32.45 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  30.15 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0780  hypothetical protein  32.26 
 
 		 462 aa  129  7.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.680411  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0949  Cof-like hydrolase  30.15 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000135628  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.71 
 
 		 468 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1489  Cof-like hydrolase  32.83 
 
 		 270 aa  122  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3317  Cof-like hydrolase  32.58 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000026375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  30.77 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  29.64 
 
 		 460 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1689  Cof family protein  28.93 
 
 		 461 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00487865  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf285  COF family HAD hydrolase protein  30.71 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0114405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2067  hydrolase  28.73 
 
 		 258 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.347224  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3240  hydrolase  29.56 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0554089  normal  0.223166 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2176  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.07 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.685473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1927  Cof-like hydrolase  29.35 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107628  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0968  HAD superfamily hydrolase  28.3 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.860573  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2161  Cof-like hydrolase  26.05 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1882  HAD superfamily hydrolase  30.08 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.07 
 
 		 258 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0840  Cof-like hydrolase  31.66 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381548 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1892  HAD superfamily hydrolase  28.46 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0504  HAD family hydrolase  28.52 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.928419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.56 
 
 		 466 aa  93.2  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0492  HAD family hydrolase  28.52 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2261  Cof-like hydrolase  30.82 
 
 		 259 aa  91.7  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000564969  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1870  class II-B haloacid dehalogenase  30.8 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.791968  normal  0.480034 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1930  HAD family hydrolase  28.03 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.57 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00143564  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2077  HAD family hydrolase  28.03 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0559  putative HAD superfamily hydrolase  28.27 
 
 		 281 aa  88.6  9e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0605487  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1822  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  28.17 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  25.55 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 		 268 aa  85.9  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  25.64 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  28.03 
 
 		 266 aa  85.5  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  28.46 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  25.55 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  30.4 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  26.14 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1562  Cof-like hydrolase  23.86 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104668  normal  0.0533762 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.81 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2159  Cof protein  28.74 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  25.65 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  24.81 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1580  Cof-like hydrolase  25.75 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.45 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  26.77 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1298  HAD superfamily hydrolase  24.91 
 
 		 286 aa  78.6  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000863241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  27.86 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  27.86 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  24.11 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  27.97 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  27.97 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  27.74 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0231  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  27.97 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  25.56 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  25.37 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  27.59 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  25.38 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  25.38 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  27.59 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  24.49 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  24.49 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  24.82 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1180  phosphotransferase  23.11 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  26.04 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  26.95 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  25 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  27.59 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  26.24 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  26.52 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  25.65 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  25.38 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1759  HAD-superfamily cof-like hydrolase  24.73 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1306  phosphotransferase  24.44 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2044  Cof-like hydrolase  23.05 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  26.62 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  30.34 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  25.38 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  25.38 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  25.56 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>