More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1759 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1759  HAD-superfamily cof-like hydrolase  100 
 
 
289 aa  600  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2223  Cof-like hydrolase  69.96 
 
 
285 aa  418  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2185  Cof-like hydrolase  69.96 
 
 
285 aa  418  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  27.43 
 
 
319 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  29.37 
 
 
281 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  27.18 
 
 
290 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0224  Cof-like hydrolase  27.08 
 
 
290 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 
282 aa  99  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.43 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  27.08 
 
 
319 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0214  HAD superfamily hydrolase  27.43 
 
 
319 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.08 
 
 
290 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  28.87 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  27.43 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.74 
 
 
290 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  29.9 
 
 
266 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.39 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  26.48 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  30.45 
 
 
279 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  29.51 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  26.13 
 
 
269 aa  89.7  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  26.13 
 
 
269 aa  89.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  30.1 
 
 
279 aa  89  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  26.21 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  26.53 
 
 
281 aa  86.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  26.3 
 
 
283 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  26.55 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  26.9 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  27.46 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  25.44 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  24.83 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 
283 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  27.03 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1298  HAD superfamily hydrolase  27.46 
 
 
286 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000863241  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  25.61 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  25.61 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  26.3 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  26.9 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  25.61 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.61 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  26.9 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  25.61 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0780  hypothetical protein  25.35 
 
 
462 aa  82.4  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.680411  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0205  HAD superfamily hydrolase  28.07 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.855458  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0259  Cof-like hydrolase  29.68 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000719541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2666  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.26 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.968723  normal  0.0125888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  25.86 
 
 
272 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  26.95 
 
 
274 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  26.95 
 
 
274 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  26.83 
 
 
269 aa  82  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  27.4 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0258  Cof-like hydrolase  27.17 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000345946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.96 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  25.44 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  26.13 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0559  putative HAD superfamily hydrolase  26.78 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0605487  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  27.15 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.61 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  26.62 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  26.62 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0492  HAD family hydrolase  25.76 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  26.46 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  28.43 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  27.3 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  26.28 
 
 
270 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  26.28 
 
 
270 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  26.28 
 
 
270 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  26.28 
 
 
270 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  26.28 
 
 
270 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  26.46 
 
 
281 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  27.95 
 
 
276 aa  79  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  26.76 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  24.65 
 
 
268 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  25.57 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0504  HAD family hydrolase  25.38 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.928419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  24.83 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  26.12 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  26.48 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  27.55 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  25.09 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1689  Cof family protein  25.17 
 
 
461 aa  75.1  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00487865  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0823  HAD superfamily hydrolase  26.13 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  24.03 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  26.94 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  24.22 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  24.39 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.4 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1822  HAD superfamily hydrolase  27.08 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0716  HAD family phosphatase  24.73 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.75 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  22.82 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  27.17 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0840  Cof-like hydrolase  25.68 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.381548 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  25.85 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.42 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0732  Cof-like hydrolase  25.17 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  25.08 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>