More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0559 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0559  putative HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
281 aa  584  1e-166  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0605487  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1151  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.22 
 
 
288 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000018456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09140  predicted HAD superfamily hydrolase  29.33 
 
 
273 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.685356  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.92 
 
 
283 aa  95.9  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000799455  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06020  predicted HAD superfamily hydrolase  31.12 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544969  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  27.4 
 
 
257 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.4 
 
 
257 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  27.4 
 
 
257 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  27.4 
 
 
257 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.76 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  26.99 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  26.99 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  27.59 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  26.99 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  26.99 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  26.99 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.4 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.99 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.05 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  27.05 
 
 
257 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.05 
 
 
257 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  26.69 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  27.05 
 
 
257 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.34 
 
 
283 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  27.36 
 
 
284 aa  89  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0716  HAD family phosphatase  28.27 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2666  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.3 
 
 
283 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.968723  normal  0.0125888 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  28.77 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  28.82 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  26.48 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  25.71 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1759  HAD-superfamily cof-like hydrolase  26.78 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  27.42 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0259  Cof-like hydrolase  25.96 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000719541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  27.96 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  26.32 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  26.32 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2185  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 
285 aa  79  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2223  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 
285 aa  79  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  28.07 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.78 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  27.76 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.84 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  28.77 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0700  putative HAD superfamily hydrolase  28.23 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  26.46 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1689  Cof family protein  25.09 
 
 
461 aa  76.3  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00487865  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  27.74 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  23.4 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  26.71 
 
 
266 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.62 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  27.36 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  25.98 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  25.78 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.08 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  24.73 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  26.69 
 
 
277 aa  72  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4042  Cof-like hydrolase  26.64 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  25.24 
 
 
319 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  27.8 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  23.41 
 
 
460 aa  72  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.86 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00143564  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  26.64 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  25.8 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  25.8 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  26.43 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.12 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4000  Cof-like hydrolase  26.3 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  26.26 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1822  HAD superfamily hydrolase  22.66 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  23.88 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1298  HAD superfamily hydrolase  27.09 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000863241  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0258  Cof-like hydrolase  23.53 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000345946  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  30.45 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  25.8 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  24.46 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2261  Cof-like hydrolase  22.86 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000564969  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  25.18 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  26.43 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  26 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3223  Cof-like hydrolase  50 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  23.32 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2044  Cof-like hydrolase  26.04 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133018  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3317  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000026375  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1892  HAD superfamily hydrolase  25.82 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  25.78 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.21 
 
 
468 aa  67  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.71 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  25.5 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.48 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0223  haloacid dehalogenase-like hydrolase  39.53 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  39.53 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1752  HAD family hydrolase  26.16 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00695054  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  25.98 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2067  hydrolase  25.27 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.347224  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  23.86 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  39.53 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>