216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06020 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_06020  predicted HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
272 aa  525  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544969  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  49.45 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000799455  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1151  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  43.31 
 
 
288 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000018456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09140  predicted HAD superfamily hydrolase  40.29 
 
 
273 aa  178  9e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.685356  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0559  putative HAD superfamily hydrolase  31.12 
 
 
281 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0605487  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.94 
 
 
466 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1489  Cof-like hydrolase  27.56 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  25.17 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0224  Cof-like hydrolase  25.68 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.17 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  24.62 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.19 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0949  Cof-like hydrolase  25.64 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000135628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  23.66 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  25.17 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2666  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.62 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.968723  normal  0.0125888 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.83 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.17 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  24.15 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0214  HAD superfamily hydrolase  24.49 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.4 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  23.47 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0504  HAD family hydrolase  22.01 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.928419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0492  HAD family hydrolase  21.91 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.27 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00143564  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  22.4 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1892  HAD superfamily hydrolase  27.51 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1298  HAD superfamily hydrolase  21.28 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000863241  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.03 
 
 
269 aa  63.5  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  23.19 
 
 
269 aa  62  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.77 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  23.94 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  21.74 
 
 
268 aa  60.1  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  24.28 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  23.26 
 
 
271 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2161  Cof-like hydrolase  23.62 
 
 
258 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  26.86 
 
 
267 aa  59.7  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1759  HAD-superfamily cof-like hydrolase  20.64 
 
 
289 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.9 
 
 
257 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  45.45 
 
 
277 aa  59.3  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0840  Cof-like hydrolase  21.97 
 
 
273 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.381548 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  27.76 
 
 
272 aa  58.9  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2185  Cof-like hydrolase  21.88 
 
 
285 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2223  Cof-like hydrolase  21.88 
 
 
285 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1870  class II-B haloacid dehalogenase  22.59 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.791968  normal  0.480034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.59 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  24.14 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2261  Cof-like hydrolase  22.06 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000564969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  21.15 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  26.22 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1930  HAD family hydrolase  26.77 
 
 
258 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2077  HAD family hydrolase  26.77 
 
 
258 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  21.74 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0700  putative HAD superfamily hydrolase  27.6 
 
 
273 aa  56.6  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  27.72 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  27.72 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  27.72 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  27.72 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  25.36 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  27.72 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  27.72 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  28.67 
 
 
270 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  28.67 
 
 
270 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  24.34 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0968  HAD superfamily hydrolase  23.85 
 
 
268 aa  55.8  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.860573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2176  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  22.43 
 
 
258 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.685473  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  23.68 
 
 
269 aa  55.5  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  25.36 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2159  Cof protein  22.1 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  24.41 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  20.65 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  21.48 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  20.65 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  21.48 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  21.48 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1882  HAD superfamily hydrolase  23.48 
 
 
258 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  21.48 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  21.48 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  30.14 
 
 
284 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  24.11 
 
 
266 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1016  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.91 
 
 
300 aa  52.8  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.650618  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.11 
 
 
278 aa  52.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0716  HAD family phosphatase  23.33 
 
 
256 aa  52.4  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  25.34 
 
 
272 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  26.64 
 
 
264 aa  52  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  38.46 
 
 
273 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  44.74 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  26.19 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  25.38 
 
 
271 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0205  HAD superfamily hydrolase  19.93 
 
 
292 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.855458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  22.14 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  26.67 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  25.38 
 
 
271 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  26.67 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>