More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2846 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 
283 aa  553  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000799455  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1151  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  48.95 
 
 
288 aa  254  8e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000018456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09140  predicted HAD superfamily hydrolase  48.52 
 
 
273 aa  226  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.685356  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06020  predicted HAD superfamily hydrolase  49.45 
 
 
272 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544969  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0559  putative HAD superfamily hydrolase  28.92 
 
 
281 aa  102  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0605487  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0700  putative HAD superfamily hydrolase  32.34 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0504  HAD family hydrolase  24.81 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.928419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0492  HAD family hydrolase  24.81 
 
 
264 aa  79  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1489  Cof-like hydrolase  27.46 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0224  Cof-like hydrolase  25.26 
 
 
290 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.89 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.57 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.57 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  24.57 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.57 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  24.23 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  22.26 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  27.46 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0214  HAD superfamily hydrolase  24.57 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.06 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00143564  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  23.89 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  21.92 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.68 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2185  Cof-like hydrolase  22.9 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  25.26 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2223  Cof-like hydrolase  22.9 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.41 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  27.56 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2161  Cof-like hydrolase  22.83 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1689  Cof family protein  26.88 
 
 
461 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00487865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  23.41 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  33.45 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  26.5 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  24.3 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  26.86 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  32.56 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  26.5 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  23.63 
 
 
283 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  23.41 
 
 
283 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  27.56 
 
 
271 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.97 
 
 
283 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  27.56 
 
 
257 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  24.38 
 
 
273 aa  63.2  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  27.05 
 
 
260 aa  62.4  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  27.21 
 
 
270 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.27 
 
 
257 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  24 
 
 
284 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  27.21 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  27.21 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  25.54 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  27.21 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.18 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  23.41 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  25.18 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  25.18 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3317  Cof-like hydrolase  21.83 
 
 
256 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000026375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  27.21 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.41 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  23.41 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  25.18 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.82 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  36.89 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  27.21 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  25.09 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  27.21 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  27.21 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.54 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  22.66 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  32.79 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  27.55 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  27.55 
 
 
281 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  25.18 
 
 
257 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  28.78 
 
 
269 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  20.89 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0968  HAD superfamily hydrolase  23.94 
 
 
268 aa  61.6  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.860573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.09 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  27.59 
 
 
270 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  25.18 
 
 
257 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2176  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  22.22 
 
 
258 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.685473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2261  Cof-like hydrolase  21.88 
 
 
259 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000564969  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  27.59 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2666  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.08 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.968723  normal  0.0125888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  27.64 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  26.12 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1298  HAD superfamily hydrolase  23.78 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000863241  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  28.41 
 
 
269 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  23.08 
 
 
283 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  42.03 
 
 
266 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  20.82 
 
 
274 aa  60.1  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  24.41 
 
 
269 aa  59.7  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  26.92 
 
 
272 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1892  HAD superfamily hydrolase  24.39 
 
 
258 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1882  HAD superfamily hydrolase  23.33 
 
 
258 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0732  Cof-like hydrolase  23.37 
 
 
287 aa  59.7  0.00000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  28.47 
 
 
272 aa  59.3  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2067  hydrolase  24.09 
 
 
258 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.347224  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  24.66 
 
 
270 aa  59.3  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  27.62 
 
 
460 aa  59.3  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  25.17 
 
 
269 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  25.52 
 
 
269 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>