172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1965 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1965  SPP-like hydrolase  100 
 
 
230 aa  461  1e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0481119  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1166  SPP-like hydrolase  81.53 
 
 
240 aa  378  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0788  SPP-like hydrolase  77.27 
 
 
228 aa  362  3e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00672208 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0866  SPP-like hydrolase  76.13 
 
 
228 aa  340  8e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1223  SPP-like hydrolase  39.04 
 
 
240 aa  155  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0131794  normal  0.788944 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2130  SPP-like hydrolase  37.14 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000000113582  hitchhiker  0.0000579549 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1070  SPP-like hydrolase  33.78 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0195406  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0884  SPP-like hydrolase  31.82 
 
 
222 aa  90.1  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2100  SPP-like hydrolase  33.48 
 
 
232 aa  85.5  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  32.73 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  31.53 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2034  phosphoglycolate phosphatase  28.98 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.376803  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1633  SPP-like hydrolase  31.51 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.64059  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1119  SPP-like hydrolase  32.04 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.660919  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0041  SPP-like hydrolase  35.11 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  26.48 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0685  SPP-like hydrolase  27.48 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2337  phosphoglycolate phosphatase  30.09 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  0.0135027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  26.24 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  39.13 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1945  HAD family hydrolase  28.44 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  38.2 
 
 
270 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  24.81 
 
 
276 aa  62  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  38.64 
 
 
267 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  33.1 
 
 
270 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2968  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.85 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1809  SPP-like hydrolase  29.41 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.752467  normal  0.527936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3464  Cof-like hydrolase  38.64 
 
 
267 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  25.67 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  38.64 
 
 
267 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2884  SPP-like hydrolase  41.46 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  35.29 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  35.42 
 
 
267 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  22.39 
 
 
277 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  25.6 
 
 
281 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  25.6 
 
 
281 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  25.6 
 
 
270 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  25.6 
 
 
270 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  24.06 
 
 
276 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  23.02 
 
 
270 aa  55.5  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  30.81 
 
 
554 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  30.81 
 
 
554 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1097  HAD superfamily hydrolase  30.68 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000207763  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0586  HAD family hydrolase  26.21 
 
 
272 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  25.2 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  37.04 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0730  SPP-like hydrolase  33.33 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.842566  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  38.04 
 
 
272 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1727  HAD family hydrolase  28.43 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6359  Cof-like hydrolase  39.33 
 
 
271 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.164075 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  24.54 
 
 
273 aa  52.4  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  25.09 
 
 
270 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 
270 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0436  putative HAD superfamily hydrolase  24.9 
 
 
283 aa  52.4  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.237165  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  25.09 
 
 
270 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  25.09 
 
 
270 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  25.09 
 
 
270 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1156  SPP-like hydrolase  28.72 
 
 
232 aa  52.4  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902632  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  24.63 
 
 
270 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  25.09 
 
 
270 aa  52  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  25.09 
 
 
270 aa  52  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  40.24 
 
 
282 aa  52  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  24.24 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0566  HAD family hydrolase  25.32 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0688357 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  35.37 
 
 
271 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7133  Cof-like hydrolase  38.04 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1562  Cof-like hydrolase  38.16 
 
 
272 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104668  normal  0.0533762 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0388  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  30.43 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  33.7 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  26.29 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  27.8 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  26.29 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  24.24 
 
 
271 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9904  predicted protein  43.28 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0257  hydrolase  33.61 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.509124  hitchhiker  0.000575913 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2044  Cof-like hydrolase  39.47 
 
 
271 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133018  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  26.85 
 
 
269 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0938  SPP-like hydrolase  27.81 
 
 
223 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  24.32 
 
 
266 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  31.11 
 
 
270 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  25.9 
 
 
269 aa  49.3  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3317  Cof-like hydrolase  25.3 
 
 
256 aa  48.9  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000026375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  27.1 
 
 
266 aa  48.9  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0949  Cof-like hydrolase  26.34 
 
 
258 aa  48.5  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000135628  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  24.32 
 
 
266 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  22.14 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  29.51 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  24.29 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0540  HAD superfamily hydrolase  35.06 
 
 
277 aa  47.8  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.467254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  31.52 
 
 
550 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  21.19 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  27.91 
 
 
272 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  37.66 
 
 
275 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6758  predicted protein  33.64 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.254301 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  28.27 
 
 
698 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2045  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.53 
 
 
280 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  35.37 
 
 
272 aa  46.6  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  29.57 
 
 
278 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  25.21 
 
 
260 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  23.72 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>