More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1727 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1727  HAD family hydrolase  100 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8838  hypothetical protein  57.52 
 
 		 572 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1945  HAD family hydrolase  50.68 
 
 		 250 aa  211  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  41.63 
 
 		 554 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  41.63 
 
 		 554 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 550 aa  101  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2884  SPP-like hydrolase  31.28 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0730  SPP-like hydrolase  29.22 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.842566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2337  phosphoglycolate phosphatase  28 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  0.0135027 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  26.59 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  24.33 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  24.33 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  24.33 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  24.33 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0257  hydrolase  30.33 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.509124  hitchhiker  0.000575913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  24.33 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  24.33 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  23.95 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  24.33 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  24.33 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  25.83 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  25.83 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  25.83 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  25.86 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2100  SPP-like hydrolase  28.82 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  25.46 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  22.31 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  25.46 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  25.46 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  24.81 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  24.81 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  30.74 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  24.81 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  24.81 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  24.81 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  47.06 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1101  HAD family hydrolase  26.55 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.744434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  24.37 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0840  Cof-like hydrolase  26.27 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.04 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0788  SPP-like hydrolase  30.17 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00672208 
 
 
-
 
NC_002950  PG1653  hypothetical protein  27.2 
 
 		 407 aa  62.4  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  23.72 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  25 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  24.26 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1633  SPP-like hydrolase  30.49 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.64059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  23.89 
 
 		 257 aa  62  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  24.5 
 
 		 244 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  25.09 
 
 		 271 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  25.83 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  24.44 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  25.09 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2034  phosphoglycolate phosphatase  26.8 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.376803  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  24.72 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  25.46 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  25.09 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  23.94 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  24.72 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2044  Cof-like hydrolase  32.2 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3590  HAD family hydrolase  27.76 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.684772  normal  0.0477257 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1119  SPP-like hydrolase  32.7 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.660919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  30.63 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  38.03 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  38.55 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  31 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  44.87 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.94 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0716  HAD family phosphatase  25.82 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0120  Cof-like hydrolase  47.95 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  28.4 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  21.32 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  21.43 
 
 		 271 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.24 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  27.31 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.5 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  38.03 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1070  SPP-like hydrolase  25.33 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0195406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  22.27 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  38.37 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  38.37 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  38.37 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  22.39 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  45.71 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.5 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  23.25 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  36.36 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1809  SPP-like hydrolase  31.96 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.752467  normal  0.527936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0388  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  25.12 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  35.29 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  36.84 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0908  sugar phosphatase SupH  33.75 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0364  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  21.7 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  25.57 
 
 		 266 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  23.83 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  23.35 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  27 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>