More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0041 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0041  SPP-like hydrolase  100 
 
 
233 aa  476  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  58.97 
 
 
234 aa  276  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2100  SPP-like hydrolase  52.59 
 
 
232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  49.57 
 
 
232 aa  246  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  45.54 
 
 
226 aa  214  7e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0884  SPP-like hydrolase  39.82 
 
 
222 aa  155  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2337  phosphoglycolate phosphatase  37.89 
 
 
226 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  0.0135027 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2034  phosphoglycolate phosphatase  37.39 
 
 
226 aa  146  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.376803  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0685  SPP-like hydrolase  30.84 
 
 
231 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1156  SPP-like hydrolase  36.65 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902632  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1633  SPP-like hydrolase  32.17 
 
 
237 aa  92  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.64059  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1119  SPP-like hydrolase  30.8 
 
 
227 aa  89.4  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.660919  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1070  SPP-like hydrolase  27.47 
 
 
228 aa  85.9  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0195406  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1166  SPP-like hydrolase  34.05 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1809  SPP-like hydrolase  32.29 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.752467  normal  0.527936 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1965  SPP-like hydrolase  35.11 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0481119  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  26.52 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  28.24 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  26.42 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2968  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.31 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.08 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.19 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0732  Cof-like hydrolase  23.18 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  24.72 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.17 
 
 
269 aa  72  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  24.6 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  26.25 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.5 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0788  SPP-like hydrolase  31.11 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00672208 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  26.36 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  25.47 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  27.16 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl513  HAD-superfamily cof-like hydrolase  21.48 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  29.07 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  23.11 
 
 
272 aa  67  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  24.53 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  24.81 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  25.28 
 
 
281 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  19.03 
 
 
277 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  23.66 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  28.28 
 
 
272 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  25.28 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.24 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2130  SPP-like hydrolase  27.64 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000000113582  hitchhiker  0.0000579549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.15 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  23.75 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  25.18 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  25.65 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  24.91 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  25.27 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  26.87 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.63 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0949  Cof-like hydrolase  23.23 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000135628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  26.85 
 
 
267 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  25.84 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  23.77 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  26.07 
 
 
267 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.77 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.77 
 
 
257 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  40.85 
 
 
274 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  28.08 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1851  Cof-like hydrolase  23.9 
 
 
274 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  26.47 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0866  SPP-like hydrolase  33.93 
 
 
228 aa  64.3  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  27.2 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.01 
 
 
282 aa  63.2  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3074  Cof-like hydrolase  24.28 
 
 
306 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  25.48 
 
 
285 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  25.67 
 
 
271 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  23.77 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  25.74 
 
 
271 aa  62.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  23.77 
 
 
279 aa  62.4  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.86 
 
 
258 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0138  Cof-like hydrolase  24.18 
 
 
279 aa  62.4  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  33.64 
 
 
270 aa  62  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  33.64 
 
 
270 aa  62  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  33.64 
 
 
270 aa  62  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  33.64 
 
 
270 aa  62  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  33.64 
 
 
270 aa  62  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  26.87 
 
 
263 aa  62  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.26 
 
 
265 aa  62.4  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  33.64 
 
 
270 aa  62  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2161  Cof-like hydrolase  26.45 
 
 
258 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  33.64 
 
 
270 aa  62  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  33.64 
 
 
270 aa  62  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  23.42 
 
 
266 aa  61.6  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  23.08 
 
 
271 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  45.95 
 
 
274 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  23.19 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  27.61 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  22.93 
 
 
268 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  25.7 
 
 
264 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  35.64 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  25.56 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2176  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.21 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.685473  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  35.64 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  21.98 
 
 
279 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1223  SPP-like hydrolase  28.03 
 
 
240 aa  60.5  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0131794  normal  0.788944 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  22.76 
 
 
273 aa  60.5  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>