74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5151 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5151  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 
321 aa  661    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3590  HAD family hydrolase  54.77 
 
 
270 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.684772  normal  0.0477257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3874  HAD family hydrolase  50.2 
 
 
260 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0597322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0088  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  51.27 
 
 
265 aa  251  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0566  HAD family hydrolase  48.54 
 
 
251 aa  209  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0688357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0610  HAD family hydrolase  36.4 
 
 
282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000152168 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5196  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.33 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2053  HAD family hydrolase  34.07 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2219  HAD family hydrolase  32.43 
 
 
259 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4690  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.37 
 
 
275 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2056  HAD family hydrolase  32.13 
 
 
268 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413042  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2097  HAD family hydrolase  28.85 
 
 
268 aa  102  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.978592  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4133  HAD family hydrolase  31.06 
 
 
271 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0769  HAD family hydrolase  30.31 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0183682  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6271  HAD family hydrolase  30.89 
 
 
263 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.690052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1558  HAD family hydrolase  30.89 
 
 
263 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2700  HAD family hydrolase  28.12 
 
 
270 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5210  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.52 
 
 
281 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.43756 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6760  HAD family hydrolase  30.12 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3500  HAD family hydrolase  27.41 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.126173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1091  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.024164  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5932  HAD family hydrolase  28.23 
 
 
265 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4067  HAD family hydrolase  28.68 
 
 
301 aa  89.4  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1184  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.73 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24726  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0616  HAD family hydrolase  29.67 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1263  hypothetical protein  29.34 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151023  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0595  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.67 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06400  hypothetical protein  26.79 
 
 
274 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0644  HAD family hydrolase  29.13 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4456  hypothetical protein  54.1 
 
 
67 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  25.51 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  26.42 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2034  phosphoglycolate phosphatase  25.21 
 
 
226 aa  67  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.376803  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0884  SPP-like hydrolase  25.51 
 
 
222 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  21.15 
 
 
265 aa  61.6  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1223  SPP-like hydrolase  26.8 
 
 
240 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0131794  normal  0.788944 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1070  SPP-like hydrolase  26.42 
 
 
228 aa  60.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0195406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2337  phosphoglycolate phosphatase  27.13 
 
 
226 aa  59.3  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  0.0135027 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  27.18 
 
 
226 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0685  SPP-like hydrolase  24.64 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  26.91 
 
 
244 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  26.91 
 
 
244 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  24.49 
 
 
270 aa  53.1  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  24.13 
 
 
271 aa  52.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  26.67 
 
 
244 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  24.13 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  21.58 
 
 
237 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  24.13 
 
 
271 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  22.54 
 
 
271 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  23.78 
 
 
271 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  23.78 
 
 
271 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  23.78 
 
 
271 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  22.54 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.22 
 
 
267 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2130  SPP-like hydrolase  24.89 
 
 
222 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000000113582  hitchhiker  0.0000579549 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  23.16 
 
 
271 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1809  SPP-like hydrolase  27.23 
 
 
225 aa  46.6  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.752467  normal  0.527936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  36.36 
 
 
285 aa  46.6  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  25.93 
 
 
279 aa  46.6  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0730  SPP-like hydrolase  24.48 
 
 
222 aa  45.8  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.842566  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1119  SPP-like hydrolase  27.92 
 
 
227 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.660919  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0772  HAD family hydrolase YedP  22.3 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1166  SPP-like hydrolase  24.48 
 
 
240 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0041  SPP-like hydrolase  27.05 
 
 
233 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.98 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1945  HAD family hydrolase  28.93 
 
 
250 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  25 
 
 
554 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.89 
 
 
282 aa  43.5  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  25 
 
 
554 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2100  SPP-like hydrolase  23.97 
 
 
232 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  23.64 
 
 
230 aa  42.7  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0949  putative trehalose-6-phosphate phosphatase  26.1 
 
 
260 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.68 
 
 
265 aa  42.4  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1727  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
227 aa  42.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>