36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2219 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2219  HAD family hydrolase  100 
 
 		 259 aa  527  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6271  HAD family hydrolase  62.55 
 
 		 263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.690052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1558  HAD family hydrolase  62.55 
 
 		 263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6760  HAD family hydrolase  62.16 
 
 		 263 aa  315  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2700  HAD family hydrolase  42.26 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3500  HAD family hydrolase  37.7 
 
 		 267 aa  184  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.126173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0610  HAD family hydrolase  37.4 
 
 		 282 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000152168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2053  HAD family hydrolase  38.26 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1091  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.65 
 
 		 297 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.024164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5210  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.68 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.43756 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1184  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.65 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2056  HAD family hydrolase  39.76 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413042  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1263  hypothetical protein  39.27 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151023  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5932  HAD family hydrolase  32.24 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2097  HAD family hydrolase  34.2 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.978592  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0769  HAD family hydrolase  35.83 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0183682  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4690  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.29 
 
 		 275 aa  151  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0616  HAD family hydrolase  32.97 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0644  HAD family hydrolase  34.51 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0595  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.23 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4133  HAD family hydrolase  30.89 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4067  HAD family hydrolase  30.47 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06400  hypothetical protein  30.6 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5196  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.55 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3590  HAD family hydrolase  29.96 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.684772  normal  0.0477257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5151  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.43 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3874  HAD family hydrolase  27.8 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0597322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0088  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.4 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0566  HAD family hydrolase  29.77 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0688357 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.21 
 
 		 282 aa  52.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0041  SPP-like hydrolase  27.31 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  25.73 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  26.94 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1633  SPP-like hydrolase  25.1 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.64059  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  30.91 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 		 267 aa  42.4  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>