48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2053 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2053  HAD family hydrolase  100 
 
 		 287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2056  HAD family hydrolase  75.95 
 
 		 268 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1091  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  63.6 
 
 		 297 aa  328  6e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.024164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1184  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  63.6 
 
 		 297 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24726  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1263  hypothetical protein  61.69 
 
 		 295 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151023  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3500  HAD family hydrolase  48.22 
 
 		 267 aa  239  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.126173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2700  HAD family hydrolase  47.62 
 
 		 270 aa  232  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4690  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  47.51 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5932  HAD family hydrolase  46.21 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0616  HAD family hydrolase  47.46 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4133  HAD family hydrolase  45.08 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0595  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  47.1 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0644  HAD family hydrolase  41.7 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0769  HAD family hydrolase  43.14 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0183682  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2219  HAD family hydrolase  38.26 
 
 		 259 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4067  HAD family hydrolase  42.66 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0610  HAD family hydrolase  39.23 
 
 		 282 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000152168 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2097  HAD family hydrolase  33.83 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.978592  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5210  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.67 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.43756 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06400  hypothetical protein  32.34 
 
 		 274 aa  158  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1558  HAD family hydrolase  37.97 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6271  HAD family hydrolase  37.97 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.690052 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6760  HAD family hydrolase  37.97 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5196  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.67 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5151  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.07 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3874  HAD family hydrolase  27.8 
 
 		 260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0597322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3590  HAD family hydrolase  32.47 
 
 		 270 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.684772  normal  0.0477257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0088  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.89 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0566  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 251 aa  99.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0688357 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  26.45 
 
 		 232 aa  52.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  27.42 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl481  HAD-superfamily cof-like hydrolase  21.75 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  22.18 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  25.41 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.27 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  24.16 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  22.14 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  22.71 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  21.4 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1119  SPP-like hydrolase  32.23 
 
 		 227 aa  45.8  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.660919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0884  SPP-like hydrolase  24.41 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0041  SPP-like hydrolase  27.39 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2337  phosphoglycolate phosphatase  22.96 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  0.0135027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  25.8 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  37.33 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  22.74 
 
 		 276 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  19.78 
 
 		 257 aa  43.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  34.33 
 
 		 277 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>