34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2700 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2700  HAD family hydrolase  100 
 
 		 270 aa  542  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3500  HAD family hydrolase  53.12 
 
 		 267 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.126173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1091  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  47.53 
 
 		 297 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.024164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1184  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  47.53 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2053  HAD family hydrolase  47.62 
 
 		 287 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2056  HAD family hydrolase  45.95 
 
 		 268 aa  231  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413042  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1263  hypothetical protein  47.58 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151023  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0769  HAD family hydrolase  43.46 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0183682  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2219  HAD family hydrolase  42.26 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0644  HAD family hydrolase  39.58 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5932  HAD family hydrolase  38.87 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5210  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.43 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.43756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1558  HAD family hydrolase  37.17 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6271  HAD family hydrolase  37.17 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.690052 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6760  HAD family hydrolase  37.83 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2097  HAD family hydrolase  33.95 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.978592  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0610  HAD family hydrolase  36.69 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000152168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4133  HAD family hydrolase  38.26 
 
 		 271 aa  165  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4690  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40.49 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06400  hypothetical protein  33.7 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0616  HAD family hydrolase  37.05 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0595  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.65 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5196  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.11 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4067  HAD family hydrolase  36.19 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3590  HAD family hydrolase  29.8 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.684772  normal  0.0477257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0088  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.13 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3874  HAD family hydrolase  26.8 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0597322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5151  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.12 
 
 		 321 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0566  HAD family hydrolase  30.04 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0688357 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  26.53 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0041  SPP-like hydrolase  23.81 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2176  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.85 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.685473  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.03 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  35.38 
 
 		 257 aa  42  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>