More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0546 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.47 
 
 
739 aa  932    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
740 aa  1507    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.67 
 
 
744 aa  511  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.86 
 
 
756 aa  503  1e-141  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.87 
 
 
744 aa  503  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.57 
 
 
744 aa  489  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.57 
 
 
751 aa  488  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.82 
 
 
744 aa  477  1e-133  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.42 
 
 
815 aa  387  1e-106  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 
764 aa  293  7e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_840  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  30.61 
 
 
764 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.94 
 
 
962 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.7 
 
 
959 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.48 
 
 
764 aa  281  4e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.67 
 
 
1053 aa  276  7e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.61 
 
 
972 aa  272  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  30.79 
 
 
797 aa  268  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5321  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.11 
 
 
764 aa  266  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.22 
 
 
768 aa  261  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.32 
 
 
778 aa  261  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3881  Protein of unknown function DUF1998  29.82 
 
 
795 aa  257  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0572  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.59 
 
 
775 aa  257  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.39 
 
 
815 aa  254  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35840  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  29.81 
 
 
798 aa  253  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0109244  normal  0.0530492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.42 
 
 
773 aa  253  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.45 
 
 
763 aa  251  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5571  Protein of unknown function DUF1998  30.96 
 
 
761 aa  250  7e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.26 
 
 
808 aa  249  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.14 
 
 
807 aa  248  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  28.09 
 
 
986 aa  249  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.71 
 
 
789 aa  248  3e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0511  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.5 
 
 
739 aa  243  7e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.814841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2984  helicase superfamily protein  28.13 
 
 
862 aa  243  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000404432  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.48 
 
 
804 aa  242  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29 
 
 
973 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.73 
 
 
805 aa  242  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.64 
 
 
764 aa  241  4e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0123  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.57 
 
 
761 aa  241  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0336832  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2730  DEAD/DEAH box helicase-like  29.34 
 
 
751 aa  241  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.37 
 
 
751 aa  240  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25230  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  29.62 
 
 
780 aa  240  6.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0673  NADPH-dependent FMN reductase  28.98 
 
 
738 aa  239  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.61 
 
 
815 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.05 
 
 
868 aa  236  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000944502  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.28 
 
 
753 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.21 
 
 
781 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036578  normal  0.532638 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.93 
 
 
1198 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  27.68 
 
 
912 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4033  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.76 
 
 
802 aa  233  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3155  Helicase superfamily 1 and 2 ATP-binding  27.7 
 
 
795 aa  232  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.21 
 
 
896 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.450676  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.23 
 
 
1086 aa  231  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.69 
 
 
762 aa  230  6e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13678  helicase  28.51 
 
 
771 aa  229  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00132558  normal  0.157688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.59 
 
 
941 aa  229  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4414  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.59 
 
 
824 aa  226  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18140  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  26.32 
 
 
865 aa  226  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.05 
 
 
812 aa  226  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.73 
 
 
829 aa  226  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.47 
 
 
759 aa  224  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.17 
 
 
775 aa  225  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159348 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.37 
 
 
790 aa  224  4.9999999999999996e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0283  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.12 
 
 
807 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.35 
 
 
752 aa  223  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8451  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.84 
 
 
806 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4799  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.8 
 
 
775 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4885  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.8 
 
 
775 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60576  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5399  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.96 
 
 
782 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265021  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  27.56 
 
 
831 aa  220  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.77 
 
 
758 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  26.81 
 
 
1210 aa  212  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.09 
 
 
685 aa  211  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4829  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.95 
 
 
807 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0625  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.12 
 
 
803 aa  209  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.47 
 
 
803 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  26.16 
 
 
815 aa  201  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  25.63 
 
 
758 aa  197  6e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0330  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.89 
 
 
868 aa  183  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4301  DEAD/DEAH box helicase-like  30.22 
 
 
804 aa  177  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0220  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.65 
 
 
902 aa  177  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  23.01 
 
 
905 aa  174  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1976  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.87 
 
 
838 aa  169  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.71 
 
 
855 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2771  Protein of unknown function DUF1998  28.28 
 
 
866 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00683804  hitchhiker  0.000025981 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.54 
 
 
766 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.801207  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26090  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  28.14 
 
 
833 aa  163  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00586248  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.22 
 
 
861 aa  162  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  24.42 
 
 
906 aa  161  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.55 
 
 
931 aa  160  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62134  predicted protein  24.04 
 
 
1178 aa  159  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.81 
 
 
909 aa  157  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33220  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  25.79 
 
 
891 aa  157  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442514  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0601  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.31 
 
 
848 aa  156  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0735  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.11 
 
 
790 aa  154  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773858  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.52 
 
 
897 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  27.29 
 
 
898 aa  153  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.95 
 
 
944 aa  153  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.42 
 
 
926 aa  152  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  30 
 
 
955 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.29 
 
 
903 aa  148  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>