166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5086 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5086  porin  100 
 
 		 274 aa  535  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  79.56 
 
 		 274 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  79.93 
 
 		 274 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  50.89 
 
 		 285 aa  232  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  50.89 
 
 		 285 aa  231  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  47.52 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  50.94 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  48.31 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  47.59 
 
 		 279 aa  188  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  50.57 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3848  porin  46.07 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  49.09 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  44.59 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  49.44 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  47.18 
 
 		 289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  47.18 
 
 		 289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  45.67 
 
 		 296 aa  178  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  45.67 
 
 		 296 aa  178  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  48.5 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  44.72 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2142  porin  44.94 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  41.87 
 
 		 302 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  46.69 
 
 		 287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  42.81 
 
 		 288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  41.84 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  45.05 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  43.84 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  43.84 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  43.84 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  42.67 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  44.56 
 
 		 287 aa  158  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  42.97 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4466  porin  42.81 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4355  porin  44.09 
 
 		 288 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.64859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3986  porin  44.09 
 
 		 288 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0565804  normal  0.846216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  43.21 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3321  porin  44.13 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2044  porin  43.16 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7845  porin  44.23 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1624  porin  43.8 
 
 		 285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  37.83 
 
 		 571 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  38.58 
 
 		 583 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  40.58 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  34.21 
 
 		 283 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  32.26 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  35.06 
 
 		 453 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  31.9 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  33.95 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  32.81 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  36.19 
 
 		 452 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  30.66 
 
 		 244 aa  97.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  36.78 
 
 		 447 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  32.06 
 
 		 258 aa  95.5  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  29.64 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  32.81 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  33.98 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  33.07 
 
 		 577 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  32.2 
 
 		 237 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.68 
 
 		 206 aa  87  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  32.25 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  36.02 
 
 		 236 aa  86.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  32.14 
 
 		 207 aa  86.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  34.84 
 
 		 254 aa  85.9  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  31.88 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  33.33 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  40 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  30.49 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.02 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  29.04 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  35.15 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.66 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  31.18 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  30.62 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0836  porin  37.92 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0404918  normal  0.853535 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  29.96 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  29.96 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  31.13 
 
 		 570 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.15 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  30.61 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  33.79 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  35.31 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  28.99 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  29.27 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.62 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  32.77 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  27.74 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  27.02 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  30.54 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  26.92 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  33.05 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  31.3 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  29.74 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  30.19 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  31.11 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  29.6 
 
 		 997 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  27.21 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  26.98 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  28.74 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  30 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  31.47 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>