63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0580 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  331  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  44.76 
 
 
159 aa  108  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  37.23 
 
 
158 aa  90.5  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  31.75 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  28.47 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  31.34 
 
 
181 aa  57.4  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  29.09 
 
 
180 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  32.84 
 
 
172 aa  51.6  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  25.9 
 
 
170 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  32.58 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  28.39 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  32.58 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  31.93 
 
 
358 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  33.82 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  30.43 
 
 
209 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  27.89 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  31.75 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  28.26 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  32.41 
 
 
185 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  30.77 
 
 
206 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  30.22 
 
 
190 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  32.41 
 
 
185 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  32.41 
 
 
185 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  27.81 
 
 
192 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  30.94 
 
 
221 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  31.72 
 
 
184 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  30.71 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1769  hypothetical protein  28.46 
 
 
139 aa  47.8  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  30.71 
 
 
168 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1771  hypothetical protein  29.66 
 
 
154 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  29.19 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  28.99 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  26.92 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  28.35 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  30.53 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  32.58 
 
 
185 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3513  hypothetical protein  30.53 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  26.71 
 
 
181 aa  45.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  28.97 
 
 
190 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  28.78 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  31.62 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  30.6 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  32.03 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  29.24 
 
 
224 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  28.46 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  30.77 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  31.93 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3645  hypothetical protein  30.16 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  28.77 
 
 
450 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3656  hypothetical protein  27.56 
 
 
143 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1484  hypothetical protein  25.2 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  28.47 
 
 
146 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2633  hypothetical protein  32.03 
 
 
149 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708671  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2648  hypothetical protein  32.03 
 
 
149 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2604  hypothetical protein  32.03 
 
 
149 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  28.03 
 
 
179 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1825  hypothetical protein  27.4 
 
 
172 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2216  hypothetical protein  26.62 
 
 
170 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.931621  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  22.81 
 
 
177 aa  40.8  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2149  enzyme  25 
 
 
208 aa  40.4  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>