More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3005 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 290 aa  588  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  69.66 
 
 		 295 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  66.67 
 
 		 302 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  64.85 
 
 		 299 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  66.67 
 
 		 297 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  63.23 
 
 		 291 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  66.67 
 
 		 297 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  61.72 
 
 		 293 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  58.97 
 
 		 290 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  62.76 
 
 		 291 aa  362  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  58.48 
 
 		 290 aa  362  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  60.69 
 
 		 292 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  59.44 
 
 		 291 aa  358  6e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  59.52 
 
 		 290 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  60.34 
 
 		 292 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  57.24 
 
 		 294 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  62.14 
 
 		 278 aa  354  8.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  62.5 
 
 		 291 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  60.75 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  59.93 
 
 		 307 aa  352  5e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  59.31 
 
 		 339 aa  351  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  61.46 
 
 		 291 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  60.82 
 
 		 291 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  58.97 
 
 		 291 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  58.97 
 
 		 291 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  58.97 
 
 		 291 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  58.97 
 
 		 339 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  58.97 
 
 		 291 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  58.28 
 
 		 291 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  58.28 
 
 		 291 aa  341  8e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  59.38 
 
 		 291 aa  340  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  57.59 
 
 		 291 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  57.24 
 
 		 291 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  57.24 
 
 		 291 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  57.24 
 
 		 291 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  58.84 
 
 		 275 aa  328  7e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  57.61 
 
 		 280 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  56.51 
 
 		 291 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  58.05 
 
 		 275 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  58.21 
 
 		 300 aa  325  5e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  56.49 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  57.14 
 
 		 275 aa  322  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  59.7 
 
 		 278 aa  322  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  56.29 
 
 		 275 aa  319  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  58.94 
 
 		 268 aa  318  6e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  56.55 
 
 		 291 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  58.51 
 
 		 291 aa  315  5e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  58.04 
 
 		 256 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  54.61 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  54.24 
 
 		 269 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  54.24 
 
 		 267 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  54.07 
 
 		 271 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  54.07 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  53.33 
 
 		 271 aa  299  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  53.33 
 
 		 271 aa  299  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  53.7 
 
 		 271 aa  298  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  52.94 
 
 		 291 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  52.94 
 
 		 291 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  52.94 
 
 		 291 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  52.94 
 
 		 291 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  52.96 
 
 		 270 aa  295  6e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  54.44 
 
 		 290 aa  295  9e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  54.44 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  54.44 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  45.79 
 
 		 277 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  51.58 
 
 		 290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  50.19 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  45.77 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  32.26 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  33.61 
 
 		 246 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  32.92 
 
 		 247 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  32.92 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  30.24 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  32.81 
 
 		 261 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  29.29 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  32.67 
 
 		 324 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  35.4 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  35.4 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  34.96 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  31.25 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  35.74 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  36.36 
 
 		 250 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  29.43 
 
 		 248 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  35.47 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  32.52 
 
 		 230 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  31.93 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  32.93 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  32.93 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  32.93 
 
 		 230 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  35.59 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  35.59 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  35.59 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  35.59 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  35.59 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  35.59 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  31.63 
 
 		 214 aa  104  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  35.59 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  33.61 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>