More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2116 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  318  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4270  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.34453  normal  0.84826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0800  putative leucine-responsive regulatory protein  49.34 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338493  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1595  bkd operon transcriptional regulator  49.34 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1107  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1764  putative leucine-responsive regulatory protein  49.34 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1184  bkd operon transcriptional regulator  49.34 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0665  putative leucine-responsive regulatory protein  49.34 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2393  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1672  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.483706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  43.62 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6006  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4348  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4231  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0970255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4019  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814285  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3757  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349158  normal  0.199057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0110  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  43.71 
 
 		 166 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 181 aa  127  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.87 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 155 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  44.23 
 
 		 173 aa  122  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 175 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  41.83 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 166 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  38.93 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  44.08 
 
 		 189 aa  121  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  38.93 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  38.93 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  40.27 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  38.93 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 		 161 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 202 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 163 aa  120  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  43.51 
 
 		 158 aa  120  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  38.93 
 
 		 229 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 202 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>