More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7817 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7817  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  261  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  41.12 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  38.58 
 
 		 126 aa  87.4  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 127 aa  86.7  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  42.2 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  40.74 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  39.37 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  36.36 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  38.18 
 
 		 126 aa  76.6  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  35.78 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  37.04 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  32.8 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  37.04 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  36.7 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  31.25 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  36.11 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  35.4 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  34.58 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  42.11 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  36.07 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  35.16 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  37.4 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  41.57 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  40.74 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  38.18 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  35.19 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>