70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5560 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  81.44 
 
 		 288 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  60.08 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  59.69 
 
 		 327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  60.64 
 
 		 270 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  54.31 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  42.86 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  38.01 
 
 		 250 aa  159  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  30.47 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.9 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  30.45 
 
 		 322 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.36 
 
 		 329 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  31.88 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  32.79 
 
 		 286 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  32.79 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  31.63 
 
 		 259 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  28.5 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  30.69 
 
 		 275 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  29.74 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  32.93 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.88 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  29.41 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  29.82 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  29.85 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  29.29 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  30.93 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  29.28 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  29.56 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  30.73 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  29.79 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  26.47 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  26.74 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  28.65 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  32.45 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.88 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  31.03 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  26.53 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  26.81 
 
 		 201 aa  49.7  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  27.84 
 
 		 239 aa  49.3  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  25.97 
 
 		 213 aa  49.3  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  32.8 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  28.23 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  25.64 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  26.28 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  25.64 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  28.1 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  27.42 
 
 		 204 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.17 
 
 		 241 aa  46.2  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.17 
 
 		 241 aa  46.2  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  28.57 
 
 		 189 aa  45.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  33.71 
 
 		 188 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  29.41 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  31.58 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  29.63 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  28.04 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23070  Arylesterase protein  29.57 
 
 		 198 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  32.21 
 
 		 200 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  32.41 
 
 		 210 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  28.97 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  26.24 
 
 		 252 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.13 
 
 		 226 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  27.73 
 
 		 201 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  28.66 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  28.35 
 
 		 214 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  28.57 
 
 		 216 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  29.91 
 
 		 188 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  28.71 
 
 		 201 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  27.73 
 
 		 199 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2979  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000369688  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>