More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5476 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  61.35 
 
 		 786 aa  897    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  61.69 
 
 		 786 aa  892    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.74 
 
 		 770 aa  719    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.05 
 
 		 769 aa  676    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  47.91 
 
 		 771 aa  673    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 782 aa  1553    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.63 
 
 		 775 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  47.8 
 
 		 774 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  47.01 
 
 		 771 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 		 775 aa  643    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  88.67 
 
 		 764 aa  1309    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.02 
 
 		 795 aa  735    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2369  multi-sensor signal transduction histidine kinase  60.41 
 
 		 793 aa  807    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.9 
 
 		 797 aa  747    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  61.61 
 
 		 786 aa  898    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  45.2 
 
 		 779 aa  629  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.56 
 
 		 774 aa  600  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.47 
 
 		 784 aa  595  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  46.69 
 
 		 783 aa  589  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  46.69 
 
 		 783 aa  589  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 769 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.82 
 
 		 772 aa  587  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.25 
 
 		 769 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  47.35 
 
 		 790 aa  549  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  39.22 
 
 		 773 aa  515  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.84 
 
 		 600 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.48 
 
 		 911 aa  420  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 		 844 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 1169 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 661 aa  233  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 		 1313 aa  228  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  33.02 
 
 		 786 aa  228  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0015  histidine kinase  36.34 
 
 		 868 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 773 aa  221  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 		 778 aa  219  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1357  cytoplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 		 849 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 523 aa  212  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0025  histidine kinase  35.9 
 
 		 849 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  39.94 
 
 		 503 aa  212  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.13 
 
 		 798 aa  211  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 513 aa  208  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  39.69 
 
 		 599 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 617 aa  205  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 1501 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.01 
 
 		 1352 aa  202  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  27.84 
 
 		 1255 aa  200  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  45.81 
 
 		 525 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 		 573 aa  198  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 		 468 aa  196  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 646 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 		 502 aa  196  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  30.25 
 
 		 1560 aa  195  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 583 aa  194  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 389 aa  194  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 846 aa  194  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  45.73 
 
 		 648 aa  194  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 856 aa  193  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  46.19 
 
 		 508 aa  193  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 		 518 aa  193  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 		 643 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 717 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 738 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 		 511 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  43.04 
 
 		 532 aa  191  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 548 aa  191  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.73 
 
 		 513 aa  191  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 630 aa  190  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 		 1274 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  45.73 
 
 		 513 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  45.73 
 
 		 513 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 371 aa  189  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 1363 aa  189  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 1069 aa  187  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  31.89 
 
 		 761 aa  187  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  44.09 
 
 		 288 aa  186  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 		 1369 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 505 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 		 917 aa  187  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 531 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 530 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 646 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  42.86 
 
 		 513 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 456 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 536 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 		 377 aa  186  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 536 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1473  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.07 
 
 		 1380 aa  185  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  38.91 
 
 		 470 aa  184  7e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 620 aa  184  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.29 
 
 		 562 aa  184  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  31.97 
 
 		 823 aa  183  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 512 aa  183  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 530 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 1046 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 594 aa  182  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 989 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 704 aa  182  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.99 
 
 		 1145 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 442 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>