More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5312 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  92.12 
 
 		 290 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  82.37 
 
 		 293 aa  482  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  85.16 
 
 		 297 aa  478  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  85.16 
 
 		 297 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  82.62 
 
 		 297 aa  454  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  76.1 
 
 		 290 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  72.12 
 
 		 272 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  67.52 
 
 		 284 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  69.47 
 
 		 280 aa  361  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  67.67 
 
 		 281 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  67.63 
 
 		 286 aa  358  7e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  70.38 
 
 		 292 aa  355  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  70.38 
 
 		 286 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1281  ABC transporter, permease protein  68.97 
 
 		 267 aa  348  6e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640698  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  61.98 
 
 		 263 aa  318  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  65.9 
 
 		 277 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  63.85 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  60.55 
 
 		 270 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  56.37 
 
 		 258 aa  295  7e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  58.27 
 
 		 260 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  59.62 
 
 		 263 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  59.23 
 
 		 263 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  58.08 
 
 		 263 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  58.56 
 
 		 269 aa  278  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  57.31 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1945  ABC-2 type transporter  58.4 
 
 		 263 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0850168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  53.76 
 
 		 280 aa  245  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  53.52 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3036  ABC-2 type transporter  53.57 
 
 		 295 aa  241  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4979  ABC-2 type transporter  53.6 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2590  efflux ABC transporter, permease protein  53.31 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  30.93 
 
 		 284 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  29.87 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  28.44 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  31.31 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.44 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.95 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  28.37 
 
 		 250 aa  95.9  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.45 
 
 		 264 aa  95.5  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  28.44 
 
 		 254 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.32 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  28.45 
 
 		 249 aa  93.2  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.81 
 
 		 249 aa  92.4  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.24 
 
 		 249 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  26.35 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.17 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  26.15 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.08 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.98 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  29.95 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.33 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  26.03 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  29.82 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.08 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.89 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  24.24 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.08 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  25.28 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  26.41 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  27.4 
 
 		 665 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.77 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  21.27 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  27.16 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  23.15 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  27.4 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  20.45 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  27.99 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  27.05 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0899  ABC transporter, inner membrane subunit  27.27 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208954  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  28.7 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>