279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3703 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  100 
 
 		 154 aa  314  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  66.88 
 
 		 154 aa  215  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  67.12 
 
 		 155 aa  191  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  65.1 
 
 		 155 aa  190  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  61.69 
 
 		 153 aa  186  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  59.73 
 
 		 152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  57.33 
 
 		 157 aa  179  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  54.55 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  54.55 
 
 		 157 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  57.53 
 
 		 159 aa  170  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  56.94 
 
 		 163 aa  167  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.65 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.65 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.93 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  53.25 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.78 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  55.22 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  50.65 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  57.04 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.08 
 
 		 163 aa  153  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  55.3 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  50.99 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  53.79 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  50.35 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  50.35 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  55.32 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.7 
 
 		 145 aa  149  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  56.34 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  56.82 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.47 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  55.32 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  56.03 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  53.33 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.72 
 
 		 145 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.32 
 
 		 159 aa  147  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.49 
 
 		 145 aa  146  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.56 
 
 		 156 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.73 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  54.23 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.32 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  54.23 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.59 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.43 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.66 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  50.7 
 
 		 145 aa  143  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  48.59 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.31 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.32 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  47.65 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  51.88 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  53.38 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  48.59 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  53.38 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  48.59 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  49.67 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  55.63 
 
 		 158 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.63 
 
 		 158 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  55.63 
 
 		 158 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.59 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.98 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  48.99 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.99 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  48.99 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.98 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.97 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  52.63 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  54.55 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  48.59 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.89 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  52.11 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  47.89 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  46.98 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.41 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.93 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.64 
 
 		 159 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.89 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  49.64 
 
 		 159 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  50.35 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.43 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.18 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.98 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  48.94 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  46.48 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  48.59 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  47.89 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  47.89 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.53 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  50.36 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.26 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  49.29 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  39.85 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  39.39 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  47.55 
 
 		 149 aa  123  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  47.86 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  39.31 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  46.48 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.48 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  46.48 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>