123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3059 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3059  co-chaperone Hsc20  100 
 
 
207 aa  426  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33536  predicted protein  38.42 
 
 
237 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.942006  normal  0.145208 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0825  co-chaperone Hsc20  39.32 
 
 
205 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484161  normal  0.641557 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0595  co-chaperone Hsc20  36.14 
 
 
205 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0720  co-chaperone HscB  35.23 
 
 
171 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0676  co-chaperone Hsc20  39.47 
 
 
181 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0621  co-chaperone Hsc20  35.15 
 
 
205 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.567041  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0630  co-chaperone Hsc20  35.15 
 
 
205 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0280  co-chaperone HscB  37.14 
 
 
171 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0282071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0640  co-chaperone Hsc20  35.64 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474346  normal  0.400649 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004357  chaperone protein HscB  34.1 
 
 
171 aa  98.6  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01058  co-chaperone HscB  33.53 
 
 
171 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0432  co-chaperone HscB  36.52 
 
 
174 aa  92.8  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00543464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1279  co-chaperone HscB  36.52 
 
 
174 aa  92.8  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1171  co-chaperone HscB  36.52 
 
 
174 aa  92  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1455  co-chaperone HscB  41.98 
 
 
175 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1705  co-chaperone HscB  42.62 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2729  co-chaperone HscB  42.62 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1878  co-chaperone HscB  40.74 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.328354  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1556  co-chaperone HscB  41.22 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336849  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2214  co-chaperone HscB  42.62 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3106  co-chaperone HscB  42.62 
 
 
172 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335747  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2596  co-chaperone HscB  42.62 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2652  co-chaperone HscB  42.62 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527856  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1486  co-chaperone HscB  42.62 
 
 
172 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3624  co-chaperone HscB  33.53 
 
 
173 aa  89  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.784226  normal  0.865317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0888  co-chaperone HscB  37.57 
 
 
179 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0284  co-chaperone HscB  33.72 
 
 
172 aa  88.6  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0953  co-chaperone HscB  37.13 
 
 
179 aa  88.2  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2576  co-chaperone HscB  41.22 
 
 
175 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.922422  hitchhiker  0.00128374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1062  co-chaperone HscB  37.36 
 
 
172 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1167  co-chaperone HscB  35.09 
 
 
175 aa  87  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.104058  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1028  co-chaperone HscB  41.48 
 
 
172 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121779  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1107  co-chaperone HscB  34.08 
 
 
172 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0928477  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2160  co-chaperone HscB  39.26 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.726593  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2033  co-chaperone HscB  39.26 
 
 
201 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1641  co-chaperone Hsc20  36.42 
 
 
172 aa  85.1  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5429  co-chaperone HscB  41.53 
 
 
175 aa  85.1  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.143172  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2056  co-chaperone HscB  36.57 
 
 
183 aa  84.7  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0804061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2141  co-chaperone Hsc20  36.42 
 
 
172 aa  84.7  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00840727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1135  co-chaperone HscB  32 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2287  co-chaperone Hsc20  34.34 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.198647  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1491  co-chaperone HscB  32.96 
 
 
174 aa  82  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40370  co-chaperone HscB  36.21 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.609538  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2181  co-chaperone Hsc20  34.34 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00609006  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3996  co-chaperone Hsc20  40.16 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456652  normal  0.028593 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2202  co-chaperone HscB  45.36 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3024  co-chaperone HscB  32.37 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0260581  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2180  co-chaperone Hsc20  41.35 
 
 
177 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00471531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0481  heat shock protein DnaJ-like  33.79 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0882108  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2314  co-chaperone HscB  31.64 
 
 
173 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.963474  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02419  co-chaperone HscB  31.79 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1141  co-chaperone Hsc20  31.79 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1023  co-chaperone HscB  43.56 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187887  normal  0.466989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02383  hypothetical protein  31.79 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3758  co-chaperone HscB  31.79 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00502648  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2678  co-chaperone HscB  31.79 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1150  co-chaperone HscB  31.79 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.161773  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2902  co-chaperone HscB  31.79 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.430469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2811  co-chaperone HscB  31.79 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.275401  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2679  co-chaperone HscB  31.79 
 
 
171 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.418864  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1241  co-chaperone HscB  32.76 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2259  chaperone protein  32.75 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.334367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3508  co-chaperone HscB  35.47 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.935785  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2267  co-chaperone HscB  29.28 
 
 
174 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45826  predicted protein  31.36 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0884469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3028  co-chaperone HscB  32.5 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1044  co-chaperone Hsc20  33.33 
 
 
172 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2748  co-chaperone HscB  33.13 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1779  co-chaperone HscB  30.11 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000385415 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1435  co-chaperone Hsc20  34.48 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.506311 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1147  co-chaperone HscB  41.8 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234201  normal  0.0862801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2145  co-chaperone Hsc20  37.62 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1953  co-chaperone HscB  33.92 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00597172  normal  0.35074 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5954  co-chaperone HscB  41.8 
 
 
175 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2123  co-chaperone HscB  40 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2277  co-chaperone HscB  28.18 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113627  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2140  co-chaperone HscB  40 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0472  co-chaperone Hsc20  33.1 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.15714  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2802  co-chaperone HscB  30.64 
 
 
171 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1742  co-chaperone HscB  27.62 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000142747  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1490  co-chaperone Hsc20  39.6 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2695  co-chaperone HscB  32.73 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.48899  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1822  co-chaperone HscB  27.62 
 
 
174 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0713219  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0251  co-chaperone HscB  33.14 
 
 
177 aa  72  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1327  co-chaperone Hsc20  32.37 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2868  co-chaperone HscB  30.64 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  hitchhiker  0.0000000210214 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01469  DnaJ domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04610)  37.06 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844693  normal  0.0223479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2739  co-chaperone HscB  32.12 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2780  co-chaperone HscB  32.12 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.783416  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2914  co-chaperone HscB  32.12 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0805  co-chaperone Hsc20  38.46 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0526671  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2446  co-chaperone Hsc20  39.18 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274526  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14770  co-chaperone HscB  33.72 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1240  co-chaperone HscB  30.81 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612742  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4609  co-chaperone HscB  31.98 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155411  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1302  co-chaperone HscB  33.14 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2376  co-chaperone Hsc20  39 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.332037  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4333  co-chaperone HscB  31.98 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.147193  hitchhiker  0.000000000185961 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1461  co-chaperone HscB  26.86 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0354775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>