137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2675 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  100 
 
 		 157 aa  326  9e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2599  DNA polymerase III subunit chi  33.56 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  32.21 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1228  DNA polymerase III subunit chi  34.03 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.022673  normal  0.528347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  36.55 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0690  DNA polymerase III subunit chi  32.19 
 
 		 149 aa  87  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.435685  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0681  DNA polymerase III subunit chi  32.19 
 
 		 149 aa  87  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1071  DNA polymerase III subunit chi  34.25 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300833  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.13 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  33.33 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  32.88 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1755  DNA polymerase III subunit chi  32.19 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0767  DNA polymerase III subunit chi  34.46 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.93 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  33.79 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  33.1 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1546  hypothetical protein  34.69 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1548  DNA polymerase III, chi subunit  32.06 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  32.65 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.89 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  33.1 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.89 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0951  DNA polymerase III subunit chi  30.41 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0509  DNA polymerase III subunit chi  24.66 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01577  DNA polymerase III chi subunit  28.89 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.167803  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2557  hypothetical protein  31.65 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1542  DNA polymerase III subunit chi  32.89 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2898  DNA polymerase III subunit chi  31.82 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.21 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.21 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  32.12 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.77 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2685  hypothetical protein  31.65 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.21 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  29.8 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  32.41 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3649  DNA polymerase III subunit chi  33.09 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  30.56 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1760  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.34 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3053  DNA polymerase III subunit chi  30.82 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00465951  normal  0.254761 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1123  DNA polymerase III subunit chi  31.08 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144484 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3738  DNA-directed DNA polymerase  30.88 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4762  DNA polymerase III subunit chi  30.88 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0153251  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4825  DNA polymerase III subunit chi  30.88 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1264  DNA polymerase III subunit chi  32.73 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000426106  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3558  DNA polymerase III subunit chi  33.96 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.967018  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4862  DNA polymerase III subunit chi  30.88 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0611412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4881  DNA polymerase III subunit chi  30.88 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.983564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4732  DNA polymerase III subunit chi  30.88 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8643  normal  0.315665 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04125  DNA polymerase III subunit chi  31.21 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171112  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0892  DNA polymerase III chi subunit, HolC  33.03 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1816  DNA polymerase III subunit chi  31.76 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5780  DNA polymerase III subunit chi  31.21 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4515  DNA polymerase III subunit chi  31.21 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000205378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4830  DNA polymerase III subunit chi  31.21 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0579073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04089  hypothetical protein  31.21 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.218538  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3753  DNA polymerase III subunit chi  31.21 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4739  DNA polymerase III subunit chi  30.88 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00452125  normal  0.589357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4822  DNA polymerase III subunit chi  31.21 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00375029  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  33.85 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0904  DNA polymerase III subunit chi  28.97 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.0444908 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0443  DNA polymerase III subunit chi  30.15 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0579  DNA polymerase III, chi subunit  29.51 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.706687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3721  DNA polymerase III subunit chi  33.02 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0286  DNA polymerase III, chi subunit  25.18 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0649  DNA polymerase III chi subunit HolC  25.66 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0525  DNA polymerase III subunit chi  31.39 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0387  DNA polymerase III subunit chi  30.15 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3544  DNA polymerase III subunit chi  31.62 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0256768  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4046  DNA polymerase III subunit chi  31.62 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3680  DNA polymerase III subunit chi  31.62 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0557  DNA polymerase III chi subunit, HolC  33.59 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3528  DNA polymerase III, chi subunit  28.12 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0021621  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03636  DNA polymerase III subunit chi  31.78 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0112  DNA polymerase III subunit chi  29.66 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0096  DNA polymerase III subunit chi  29.66 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0979  DNA polymerase III subunit chi  27.13 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0917  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.5 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.741831  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1017  DNA polymerase III subunit chi  27.13 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0960  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.69 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0682  DNA polymerase III chi subunit, HolC  31.09 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.237318  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1192  DNA polymerase III subunit chi  26.85 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.369571  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2116  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.69 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0739  DNA polymerase III, chi subunit  34 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0535  DNA polymerase III subunit chi  29.41 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.815318 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002427  DNA polymerase III chi subunit  30.84 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0267935  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3563  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.72 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  26.15 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3111  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.41 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00130972  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0561  DNA polymerase III subunit chi  32.08 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3263  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.41 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1256  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.41 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00560451  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2866  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.59 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0418858  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0985  DNA polymerase III subunit chi  27.13 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1009  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.3 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3120  DNA polymerase III chi subunit HolC  30.93 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000377435  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2409  DNA polymerase III subunit chi  29.37 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.446453  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1060  DNA polymerase III chi subunit HolC  30.85 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02658  DNA polymerase III subunit chi  29.23 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1371  DNA polymerase III, chi subunit  28 
 
 		 149 aa  50.8  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.217758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>