45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0972 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  100 
 
 		 916 aa  1823    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  36.36 
 
 		 913 aa  434  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  33.58 
 
 		 911 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  34.07 
 
 		 896 aa  392  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  32.14 
 
 		 930 aa  392  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  28.38 
 
 		 872 aa  350  8e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  28.04 
 
 		 862 aa  341  4e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.94 
 
 		 940 aa  325  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  31.43 
 
 		 912 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.38 
 
 		 906 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  29.42 
 
 		 922 aa  282  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  26.57 
 
 		 858 aa  275  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  26.56 
 
 		 858 aa  273  8.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.52 
 
 		 935 aa  251  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  25.06 
 
 		 780 aa  80.5  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  28.14 
 
 		 991 aa  73.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  21.94 
 
 		 781 aa  66.6  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  22.96 
 
 		 803 aa  67  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  24.92 
 
 		 991 aa  62  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  23.03 
 
 		 984 aa  61.6  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  21.36 
 
 		 960 aa  60.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  27.39 
 
 		 1000 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  28.39 
 
 		 997 aa  55.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  19.08 
 
 		 786 aa  55.5  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  23.38 
 
 		 908 aa  54.7  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  28.71 
 
 		 997 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  23.03 
 
 		 783 aa  52.4  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.99 
 
 		 958 aa  52  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  23.53 
 
 		 864 aa  51.6  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  26.39 
 
 		 865 aa  51.2  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  25.15 
 
 		 1076 aa  50.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  23.26 
 
 		 997 aa  49.7  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  22.32 
 
 		 781 aa  48.5  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  28.18 
 
 		 990 aa  48.5  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.97 
 
 		 968 aa  48.1  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  27.18 
 
 		 980 aa  48.1  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  24.03 
 
 		 1049 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  24.39 
 
 		 919 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  23.33 
 
 		 976 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1049 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.1 
 
 		 1049 aa  46.2  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  26.95 
 
 		 856 aa  44.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  26.55 
 
 		 1052 aa  44.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  25.4 
 
 		 855 aa  44.7  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  26.52 
 
 		 993 aa  44.3  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>