More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0766 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0766  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 473 aa  958    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 478 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1471  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.72 
 
 		 472 aa  355  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.0159158 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 483 aa  354  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 487 aa  349  8e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 483 aa  345  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.25 
 
 		 480 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.46 
 
 		 479 aa  340  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3052  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  39.02 
 
 		 477 aa  340  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.383361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.04 
 
 		 492 aa  340  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0157  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 477 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00565529  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 473 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.84 
 
 		 498 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  39.41 
 
 		 473 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  38.48 
 
 		 477 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 469 aa  333  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  40.04 
 
 		 469 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 473 aa  331  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 471 aa  331  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 482 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.08 
 
 		 479 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.37 
 
 		 487 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 471 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  37.79 
 
 		 500 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 472 aa  323  6e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  39.4 
 
 		 469 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  38.57 
 
 		 473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 477 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  36.97 
 
 		 475 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  37.87 
 
 		 478 aa  320  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.72 
 
 		 484 aa  319  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  32.84 
 
 		 471 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.17 
 
 		 477 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 475 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 473 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  36.38 
 
 		 477 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  39.96 
 
 		 481 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 532 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.04 
 
 		 475 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.34 
 
 		 475 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 474 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.18 
 
 		 483 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0076  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 488 aa  310  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1067  GntR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  36.32 
 
 		 474 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 475 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 479 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 479 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4612  aminotransferase  35.24 
 
 		 480 aa  307  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  36.32 
 
 		 474 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  36.32 
 
 		 474 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 479 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 474 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  38.68 
 
 		 493 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 475 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 472 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 474 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 474 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 491 aa  306  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 473 aa  306  7e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 475 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  39.87 
 
 		 482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  36.32 
 
 		 474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  37.02 
 
 		 473 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 477 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 470 aa  302  8.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 474 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 470 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.88 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 477 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 477 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 470 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 477 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 474 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 477 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 481 aa  300  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 474 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 474 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  34.62 
 
 		 470 aa  299  8e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.97 
 
 		 474 aa  299  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 474 aa  299  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.81 
 
 		 486 aa  299  9e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  35.47 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.11 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.62 
 
 		 470 aa  298  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 471 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>