67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1148 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  674    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  94.41 
 
 
340 aa  619  1e-176  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  92.35 
 
 
340 aa  610  1e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  71.18 
 
 
340 aa  479  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  53.05 
 
 
338 aa  349  4e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  26.76 
 
 
281 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  26.48 
 
 
347 aa  84  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  22.77 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  23.12 
 
 
370 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  25.08 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  23.2 
 
 
586 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  23.12 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  23.53 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  22.65 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  22.36 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  25.53 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  24.92 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  23.44 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  22.78 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  25.41 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  23.03 
 
 
350 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2780  hypothetical protein  22.01 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  21.43 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  20.91 
 
 
342 aa  63.2  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  22.58 
 
 
351 aa  62.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  22.98 
 
 
352 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  21.71 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  22.15 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1101  hypothetical protein  22.87 
 
 
347 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0490804  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  22.15 
 
 
348 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2638  hypothetical protein  27.24 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.898598  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  24.51 
 
 
339 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  25.55 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  22.68 
 
 
574 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  28.11 
 
 
354 aa  53.1  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  25.1 
 
 
322 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  24.05 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  18.75 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  22.04 
 
 
339 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  22.73 
 
 
392 aa  49.7  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  20.82 
 
 
341 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  27.07 
 
 
346 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  22.1 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  21.8 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  22.18 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  21.6 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  25.2 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  21.19 
 
 
338 aa  47  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1193  hypothetical protein  21.91 
 
 
345 aa  46.6  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.41231  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  21.38 
 
 
337 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  27.73 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  21.83 
 
 
613 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  34.31 
 
 
342 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2298  hypothetical protein  20.6 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  25.6 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  22.01 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  24.26 
 
 
342 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0012  hypothetical protein  26.67 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  22.77 
 
 
340 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  20.81 
 
 
318 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3548  hypothetical protein  26 
 
 
321 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00235957 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  20.89 
 
 
318 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  22.44 
 
 
326 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  27.18 
 
 
840 aa  43.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  27.18 
 
 
840 aa  43.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  20.76 
 
 
392 aa  43.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  22.92 
 
 
337 aa  42.7  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>