245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2012 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
450 aa  873    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  42.89 
 
 
452 aa  346  5e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  40.89 
 
 
470 aa  327  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  43.24 
 
 
450 aa  325  8.000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  43.61 
 
 
450 aa  325  1e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  42.51 
 
 
464 aa  325  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  42.63 
 
 
453 aa  319  5e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  43.12 
 
 
452 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  40.23 
 
 
452 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  39.04 
 
 
457 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  41.53 
 
 
466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  42.12 
 
 
452 aa  309  5e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  39.91 
 
 
461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  38.9 
 
 
446 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  39.6 
 
 
468 aa  299  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  40.18 
 
 
453 aa  299  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  41.74 
 
 
457 aa  299  8e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  37.92 
 
 
452 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  41.95 
 
 
451 aa  297  3e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  40.65 
 
 
464 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  36.47 
 
 
486 aa  293  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  42.86 
 
 
453 aa  293  4e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  37.89 
 
 
454 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  39.64 
 
 
486 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  41.23 
 
 
455 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  40.72 
 
 
461 aa  286  7e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  39.3 
 
 
459 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  38.22 
 
 
450 aa  276  6e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  38.55 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  37.86 
 
 
453 aa  273  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  38.34 
 
 
453 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  37.87 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  37.25 
 
 
446 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  37.08 
 
 
446 aa  269  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  36.2 
 
 
446 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  37.67 
 
 
449 aa  266  5.999999999999999e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  36.4 
 
 
446 aa  266  8e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  38.85 
 
 
455 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  36.4 
 
 
446 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  36.4 
 
 
446 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  36.18 
 
 
446 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  36.18 
 
 
446 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  38.15 
 
 
463 aa  264  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  35.96 
 
 
446 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  36.18 
 
 
446 aa  263  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  36.18 
 
 
446 aa  262  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  36.44 
 
 
467 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  35.37 
 
 
478 aa  256  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  35.55 
 
 
476 aa  255  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  40.24 
 
 
448 aa  254  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  35.65 
 
 
465 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  35.24 
 
 
455 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  35.93 
 
 
455 aa  249  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  34.4 
 
 
463 aa  249  8e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  36.48 
 
 
467 aa  249  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  36.2 
 
 
456 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  40.64 
 
 
451 aa  247  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  36.99 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  42.38 
 
 
475 aa  243  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  33.26 
 
 
454 aa  242  1e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  36.29 
 
 
467 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  36.1 
 
 
446 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  36.2 
 
 
445 aa  237  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  36.2 
 
 
445 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  36.2 
 
 
445 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  36.2 
 
 
445 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  36.2 
 
 
445 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  36.2 
 
 
445 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  36.2 
 
 
445 aa  236  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  35.97 
 
 
445 aa  236  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  34.79 
 
 
453 aa  236  7e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  36.04 
 
 
447 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  32.65 
 
 
458 aa  233  6e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  36.04 
 
 
447 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  36.2 
 
 
445 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  38.58 
 
 
446 aa  230  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  34.3 
 
 
443 aa  230  4e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  34.43 
 
 
460 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  37.27 
 
 
448 aa  229  8e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  30.4 
 
 
454 aa  228  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12951  hypothetical protein  36.95 
 
 
447 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0640548  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13021  SNF family Na(+)-dependent transporter  36.95 
 
 
447 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  30.68 
 
 
454 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  36.75 
 
 
457 aa  226  9e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  35.76 
 
 
454 aa  225  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  35.73 
 
 
454 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  35.01 
 
 
448 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  32.8 
 
 
456 aa  222  9e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  32.8 
 
 
444 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  36.22 
 
 
447 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  34.17 
 
 
473 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  34.15 
 
 
461 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  32.51 
 
 
447 aa  216  7e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1223  SNF family Na(+)-dependent transporter  36.72 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  35.52 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  35.52 
 
 
486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  34.83 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  32.52 
 
 
450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  33.26 
 
 
451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  33.26 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>