70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2646 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 250 aa  470  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  39.84 
 
 		 251 aa  142  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  34.94 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  38.06 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  35.87 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  27.84 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  25.3 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  26.18 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  40.68 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  31.68 
 
 		 748 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  25.9 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  34.5 
 
 		 736 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  29.7 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  29.21 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  27.95 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  28.35 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  28.92 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  30.91 
 
 		 891 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  34.21 
 
 		 768 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  29.94 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  29.12 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  29.31 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  30.47 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  28.93 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.92 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  30.45 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  27.17 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.6 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  37.76 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  27.09 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  34.45 
 
 		 770 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 235 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0990  ABC transporter, permease protein, putative  41.43 
 
 		 231 aa  52.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  28.57 
 
 		 977 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  26.53 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  29.63 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  33.65 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  30.77 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  23.23 
 
 		 767 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  26.14 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  30.21 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  26.26 
 
 		 964 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4613  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  33.59 
 
 		 861 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.936466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4479  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  33.59 
 
 		 861 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  32.14 
 
 		 274 aa  45.4  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1436  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  33.59 
 
 		 862 aa  45.4  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3672  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  33.59 
 
 		 861 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342711  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5855  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  33.59 
 
 		 861 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.80419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4553  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  33.59 
 
 		 861 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5605  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  33.59 
 
 		 861 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4695  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  33.59 
 
 		 861 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3481  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  33.59 
 
 		 861 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.62532  normal  0.249237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  32.64 
 
 		 275 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1747  ABC-2 type transport system permease protein  28.57 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600827  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1533  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  32.03 
 
 		 861 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0100632  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2047  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  32.81 
 
 		 861 aa  42  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000182438 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6450  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  32.81 
 
 		 861 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.57385 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5692  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  32.81 
 
 		 861 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.596903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>