55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1379 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  494  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  42.98 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  38.72 
 
 		 253 aa  171  7.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  38.91 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.92 
 
 		 243 aa  155  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  34.03 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  33.49 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  33.06 
 
 		 237 aa  125  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  35.27 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  33.82 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  32.33 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  29.41 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  33.17 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  26.46 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  32.07 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  31.52 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.19 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  32.07 
 
 		 268 aa  85.5  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  30.12 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  29.02 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  27.04 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  29.02 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  29.31 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.79 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  28.51 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  32.39 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  29.41 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  27.93 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  27.62 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.7 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.15 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  27.85 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.64 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.72 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  26.7 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.7 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  30.59 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.98 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  28.02 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.31 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  26.79 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.08 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  31.32 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  25.97 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1537  xylose isomerase domain-containing protein  25.24 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  24.22 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  26.14 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.73 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  27.45 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3766  xylose isomerase domain-containing protein  23.32 
 
 		 306 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50217  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.29 
 
 		 270 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.65 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  27.35 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  29.17 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.7 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>