More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3293 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  56.17 
 
 
599 aa  653  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  75.08 
 
 
600 aa  923  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  60.03 
 
 
607 aa  707  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  99.83 
 
 
597 aa  1199  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  56.52 
 
 
599 aa  665  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  55.69 
 
 
616 aa  666  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  56.24 
 
 
602 aa  682  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  99.83 
 
 
597 aa  1199  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  77.98 
 
 
601 aa  934  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  59.93 
 
 
601 aa  715  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  75.42 
 
 
602 aa  924  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
597 aa  1203  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  54.5 
 
 
599 aa  633  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  53.19 
 
 
595 aa  629  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.17 
 
 
597 aa  627  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  53.81 
 
 
600 aa  622  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  52.84 
 
 
600 aa  624  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  54.41 
 
 
605 aa  617  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  51.99 
 
 
599 aa  610  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  53.48 
 
 
593 aa  597  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  51.5 
 
 
598 aa  593  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  49.92 
 
 
597 aa  588  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  50.75 
 
 
597 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  49.67 
 
 
615 aa  583  1e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  51.41 
 
 
604 aa  577  1e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  48.92 
 
 
597 aa  578  1e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  50.08 
 
 
604 aa  568  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  50.08 
 
 
602 aa  570  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  52.02 
 
 
591 aa  566  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  51.24 
 
 
606 aa  561  1e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  50.43 
 
 
596 aa  564  1e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  49.92 
 
 
599 aa  558  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  49.83 
 
 
619 aa  561  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  50.92 
 
 
606 aa  561  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  51.75 
 
 
600 aa  559  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  48.75 
 
 
602 aa  558  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  49.08 
 
 
608 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  49 
 
 
599 aa  551  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  48.99 
 
 
599 aa  548  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  48.29 
 
 
615 aa  545  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  51.04 
 
 
622 aa  543  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  49.67 
 
 
606 aa  544  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  3.27223e-05 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  52.18 
 
 
602 aa  541  1e-152  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  47.3 
 
 
612 aa  537  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  51.24 
 
 
606 aa  535  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  48.32 
 
 
632 aa  533  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  2.76011e-05 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  48.95 
 
 
603 aa  518  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  49.12 
 
 
606 aa  509  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  44.26 
 
 
609 aa  491  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  44.21 
 
 
611 aa  484  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  45.13 
 
 
609 aa  478  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.55356e-10 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  40.7 
 
 
603 aa  466  1e-130  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  41.33 
 
 
618 aa  457  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  42.86 
 
 
607 aa  451  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  41.74 
 
 
679 aa  451  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  44.39 
 
 
612 aa  440  1e-122  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  39.89 
 
 
677 aa  407  1e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  38.14 
 
 
701 aa  404  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1932  AMP-dependent synthetase and ligase  42.48 
 
 
590 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333973  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0860  AMP-binding enzyme  38.37 
 
 
682 aa  400  1e-110  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  39.86 
 
 
604 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  39.35 
 
 
604 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 
602 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  40.28 
 
 
604 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  39.01 
 
 
649 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0944  AMP-dependent synthetase and ligase  38.8 
 
 
622 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  38 
 
 
605 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  40.17 
 
 
607 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 
594 aa  385  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 
607 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  37.44 
 
 
597 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.90287e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  39.62 
 
 
606 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  38.49 
 
 
612 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  38.63 
 
 
606 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  38.63 
 
 
606 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  37.21 
 
 
602 aa  363  5e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 
602 aa  362  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 
602 aa  362  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 
617 aa  359  8e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  37.61 
 
 
613 aa  359  9e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 
622 aa  358  1e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 
609 aa  358  2e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 
603 aa  358  2e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.42642e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 
598 aa  357  4e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 
635 aa  353  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522834  normal  0.0456544 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 
633 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 
603 aa  353  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.90316e-12 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  37.3 
 
 
592 aa  352  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  34.04 
 
 
592 aa  347  4e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 
603 aa  341  3e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 
613 aa  340  4e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 
660 aa  338  1e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 
607 aa  338  2e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 
610 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 
590 aa  335  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 
610 aa  334  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 
612 aa  333  4e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 
633 aa  333  6e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 
592 aa  333  6e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 
669 aa  332  9e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>