More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2266 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  100 
 
 
249 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  91.6 
 
 
250 aa  428  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  88.31 
 
 
254 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  88.31 
 
 
254 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  88.31 
 
 
254 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  83.12 
 
 
286 aa  378  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  73.64 
 
 
252 aa  355  3e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  71.84 
 
 
271 aa  355  4e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  72.69 
 
 
248 aa  350  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.76 
 
 
273 aa  338  4e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  70.56 
 
 
236 aa  338  7e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.18 
 
 
243 aa  335  6e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  71.49 
 
 
406 aa  328  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.06 
 
 
252 aa  324  9e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.69 
 
 
242 aa  322  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.81 
 
 
246 aa  302  3e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  65.94 
 
 
246 aa  302  4e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  70.48 
 
 
231 aa  301  5e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  63.25 
 
 
255 aa  295  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  60.52 
 
 
254 aa  291  6e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  62.5 
 
 
257 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0569  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.8 
 
 
248 aa  268  7e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.63 
 
 
239 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.58 
 
 
237 aa  262  4e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.26 
 
 
244 aa  261  9e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  56.77 
 
 
246 aa  258  6e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.83 
 
 
233 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 
239 aa  253  1e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 
239 aa  253  1e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 
239 aa  253  1e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.64 
 
 
239 aa  253  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.11 
 
 
235 aa  252  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.44 
 
 
236 aa  250  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  54.11 
 
 
233 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.39 
 
 
242 aa  250  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  3.87016e-06 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  54.11 
 
 
233 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  55.75 
 
 
247 aa  250  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.67 
 
 
231 aa  249  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  52.61 
 
 
241 aa  248  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  54.87 
 
 
236 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.93 
 
 
240 aa  247  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  54.87 
 
 
238 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.04 
 
 
236 aa  246  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.65 
 
 
243 aa  246  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  57.71 
 
 
237 aa  245  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.16 
 
 
238 aa  244  7e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.46 
 
 
239 aa  244  1e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.51 
 
 
244 aa  244  1e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.64 
 
 
258 aa  242  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  53.3 
 
 
242 aa  242  4e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  54.82 
 
 
235 aa  241  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  52.42 
 
 
229 aa  238  6e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  53.65 
 
 
239 aa  237  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  57.59 
 
 
233 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  54.05 
 
 
234 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.39 
 
 
241 aa  228  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  52.7 
 
 
251 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  53.78 
 
 
234 aa  224  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  52 
 
 
252 aa  224  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.11 
 
 
236 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.94 
 
 
236 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  48.51 
 
 
243 aa  220  2e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  50.67 
 
 
241 aa  219  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 
224 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  50 
 
 
239 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  47.23 
 
 
246 aa  214  7e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 
230 aa  213  3e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 
230 aa  213  3e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 
230 aa  213  3e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  46.03 
 
 
246 aa  212  4e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
236 aa  212  4e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68356e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 
233 aa  212  6e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 
228 aa  211  6e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 
231 aa  211  8e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 
230 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  51.56 
 
 
229 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 
227 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 
227 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 
227 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 
231 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 
270 aa  207  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.98 
 
 
241 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 
240 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.11909e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 
224 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 
224 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  43.95 
 
 
227 aa  205  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 
229 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 
228 aa  203  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  46.88 
 
 
230 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.88235e-09  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 
227 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 
224 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 
224 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 
224 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  44.2 
 
 
224 aa  201  1e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  43.75 
 
 
224 aa  200  2e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  44.2 
 
 
224 aa  200  2e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  45.98 
 
 
223 aa  200  2e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  45.73 
 
 
237 aa  199  4e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 
223 aa  198  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  43.3 
 
 
224 aa  198  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>