More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1545 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1545  inner-membrane translocator  100 
 
 		 358 aa  704    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.137578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  85.47 
 
 		 358 aa  596  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  41.06 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  44.6 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  40.5 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  41 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  39.55 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  38.14 
 
 		 350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  38.14 
 
 		 350 aa  222  8e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  41.13 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  40.22 
 
 		 346 aa  209  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2306  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 357 aa  205  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  42.62 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  39.44 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0299  inner-membrane translocator  38.7 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658484  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  38.7 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0252  inner-membrane translocator  36.78 
 
 		 358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.231195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4178  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 357 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0263  inner-membrane translocator  37.03 
 
 		 358 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0217  inner-membrane translocator  37.57 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5717  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  37.82 
 
 		 357 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2722  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  0.425385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1834  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 357 aa  190  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2276  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.99 
 
 		 358 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.158559  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0951  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 358 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3414  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.38 
 
 		 357 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2374  inner-membrane translocator  45.64 
 
 		 356 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 373 aa  186  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2608  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 357 aa  185  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4574  inner-membrane translocator  38.5 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0051  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 368 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0379  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livM  36.24 
 
 		 358 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3134  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 357 aa  182  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.628981  normal  0.885727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1863  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 356 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1567  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394848  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2440  inner-membrane translocator  43.49 
 
 		 356 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2220  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120044  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4005  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000401  branched-chain amino acid transport system permease protein livM  37.57 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241122  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1557  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.505429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  34.37 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1156  inner-membrane translocator  35.08 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.412429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3610  inner-membrane translocator  36.19 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963885  normal  0.413755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5009  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 354 aa  169  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0118  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0601  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 358 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5289  inner-membrane translocator  35.75 
 
 		 357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.975087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3362  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 358 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5036  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 362 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0467  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193008  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3539  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 358 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.17747  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3437  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 354 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0458  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441083  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  36.06 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3011  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152809  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.13 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1652  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  34.37 
 
 		 340 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 389 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 389 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 358 aa  142  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.92 
 
 		 325 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4939  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 358 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.45 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43520  amino acid ABC transporter-like protein  35.26 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00847282  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 384 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.15 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.15 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.15 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0784  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.15 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 407 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  32.41 
 
 		 378 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 330 aa  139  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  35.25 
 
 		 643 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 373 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.93 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0551  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3000  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.463363  normal  0.876214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>