More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2414 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  99.77 
 
 		 436 aa  871    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  77.33 
 
 		 437 aa  666    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 436 aa  872    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  97.48 
 
 		 436 aa  855    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  77.33 
 
 		 437 aa  662    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  66.27 
 
 		 425 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  67.65 
 
 		 441 aa  537  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  66.67 
 
 		 424 aa  532  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  66.83 
 
 		 436 aa  531  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  65.28 
 
 		 432 aa  528  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  67.07 
 
 		 439 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  65.28 
 
 		 436 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  66.67 
 
 		 424 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  65.37 
 
 		 441 aa  522  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  59.35 
 
 		 437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  68.54 
 
 		 441 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  62.62 
 
 		 429 aa  511  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  59.62 
 
 		 437 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  58.88 
 
 		 437 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  64.55 
 
 		 419 aa  497  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  69.34 
 
 		 446 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  59.53 
 
 		 430 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  57.66 
 
 		 447 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  59.29 
 
 		 428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  59.95 
 
 		 441 aa  461  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  57.84 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  53.73 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  56.16 
 
 		 443 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  56.8 
 
 		 444 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  58.98 
 
 		 441 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  58.98 
 
 		 441 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  54.28 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  58.41 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  55.37 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  53.12 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  54.61 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  51.52 
 
 		 429 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  54.28 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  53.09 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  51.52 
 
 		 429 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  55.07 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  53.09 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  58.6 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  51.72 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  54.48 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  54.59 
 
 		 417 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  51.34 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  50.36 
 
 		 438 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  45.59 
 
 		 429 aa  335  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  45.1 
 
 		 430 aa  332  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  45.1 
 
 		 430 aa  332  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 422 aa  301  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  39.2 
 
 		 438 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  41.99 
 
 		 421 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 431 aa  235  9e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 416 aa  171  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  29.88 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1924  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 425 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  26.7 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  29.03 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  27.37 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  27.37 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  27.37 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  27.37 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  27.09 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 391 aa  133  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  27.09 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.42 
 
 		 410 aa  133  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 402 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 412 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  25.69 
 
 		 402 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  27.09 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  27.09 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  26.82 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  26.82 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  27.09 
 
 		 400 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  27.09 
 
 		 400 aa  130  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  27.09 
 
 		 400 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 379 aa  130  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  27.09 
 
 		 400 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  27.09 
 
 		 400 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 421 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>