More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0990 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  100 
 
 		 173 aa  331  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  46.45 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  48.28 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  48.55 
 
 		 147 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  42.86 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  44.83 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  45.39 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  42 
 
 		 158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  45.97 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  45.97 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  42.28 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  37.91 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  43.62 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  43.55 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  43.17 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  44.59 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  36.73 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  37.58 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  40.69 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  45.58 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  43.75 
 
 		 163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.25 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  39.04 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  38.93 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  39.44 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  39.04 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  36.24 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  35.03 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  35.03 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  38.51 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  39.44 
 
 		 145 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  47.11 
 
 		 165 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  39.19 
 
 		 167 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  40.41 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  39.86 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  35.58 
 
 		 185 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  39.19 
 
 		 150 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  46.1 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.38 
 
 		 164 aa  111  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.14 
 
 		 164 aa  111  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  40.79 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  40.14 
 
 		 164 aa  111  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  40.14 
 
 		 164 aa  111  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  40.14 
 
 		 164 aa  111  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  41.26 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  40.67 
 
 		 163 aa  110  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.35 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  40.14 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  37.33 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  37.33 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  37.67 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  38.36 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  40 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  39.19 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  40 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  40 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  39.31 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  40 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  39.86 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  38.97 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  40 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  37.42 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  36 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  38.1 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  38.1 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  38.1 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  36.05 
 
 		 178 aa  107  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  38.1 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.41 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  38.1 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  37.41 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.31 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  37.41 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  37.75 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  35.81 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  37.75 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  39.31 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  37.66 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  35.9 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  37.41 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  36.42 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  37.09 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  35.86 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  34.84 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  36.24 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  35.37 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  36.24 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  44.6 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.09 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  34.81 
 
 		 176 aa  104  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  36.81 
 
 		 161 aa  104  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.78 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  38.78 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  38.78 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  38.78 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  38.1 
 
 		 159 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  39.57 
 
 		 163 aa  104  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  37.93 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  35.37 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  35.81 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>